Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX3

Krt40, Keratin, type I cytoskeletal 40, mousemouse

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Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt40Q6IFX3 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt40Q6IFX3 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt40Q6IFX3 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt40Q6IFX3 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt40Q6IFX3 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt40Q6IFX3 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt40Q6IFX3 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt40Q6IFX3 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt40Q6IFX3 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt40Q6IFX3 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt40Q6IFX3 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt40Q6IFX3 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt40Q6IFX3 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt40Q6IFX3 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt40Q6IFX3 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt40Q6IFX3 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt40Q6IFX3 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt40Q6IFX3 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt40Q6IFX3 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt40Q6IFX3 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt40Q6IFX3 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt40Q6IFX3 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt40Q6IFX3 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt40Q6IFX3 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt40Q6IFX3 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt40Q6IFX3 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt40Q6IFX3 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt40Q6IFX3 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt40Q6IFX3 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt40Q6IFX3 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt40Q6IFX3 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt40Q6IFX3 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt40Q6IFX3 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt40Q6IFX3 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt40Q6IFX3 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt40Q6IFX3 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt40Q6IFX3 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt40Q6IFX3 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt40Q6IFX3 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt40Q6IFX3 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt40Q6IFX3 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt40Q6IFX3 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt40Q6IFX3 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt40Q6IFX3 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Krt40Q6IFX3 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt40Q6IFX3 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt40Q6IFX3 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt40Q6IFX3 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt40Q6IFX3 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt40Q6IFX3 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt40Q6IFX3 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt40Q6IFX3 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt40Q6IFX3 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt40Q6IFX3 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt40Q6IFX3 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt40Q6IFX3 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt40Q6IFX3 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt40Q6IFX3 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt40Q6IFX3 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt40Q6IFX3 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt40Q6IFX3 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt40Q6IFX3 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt40Q6IFX3 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Krt40Q6IFX3 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt40Q6IFX3 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt40Q6IFX3 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt40Q6IFX3 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Krt40Q6IFX3 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt40Q6IFX3 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt40Q6IFX3 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt40Q6IFX3 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt40Q6IFX3 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt40Q6IFX3 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt40Q6IFX3 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt40Q6IFX3 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt40Q6IFX3 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt40Q6IFX3 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt40Q6IFX3 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt40Q6IFX3 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt40Q6IFX3 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt40Q6IFX3 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt40Q6IFX3 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt40Q6IFX3 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt40Q6IFX3 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt40Q6IFX3 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt40Q6IFX3 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt40Q6IFX3 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt40Q6IFX3 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt40Q6IFX3 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt40Q6IFX3 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt40Q6IFX3 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt40Q6IFX3 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt40Q6IFX3 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt40Q6IFX3 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt40Q6IFX3 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt40Q6IFX3 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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