Protein–RNA interactions for Protein: Q6GSS7

Hist2h2aa1, Histone H2A type 2-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 130 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hist2h2aa1Q6GSS7 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Hist2h2aa1Q6GSS7 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hist2h2aa1Q6GSS7 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hist2h2aa1Q6GSS7 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hist2h2aa1Q6GSS7 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hist2h2aa1Q6GSS7 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hist2h2aa1Q6GSS7 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hist2h2aa1Q6GSS7 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Hist2h2aa1Q6GSS7 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hist2h2aa1Q6GSS7 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Hist2h2aa1Q6GSS7 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hist2h2aa1Q6GSS7 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hist2h2aa1Q6GSS7 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hist2h2aa1Q6GSS7 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hist2h2aa1Q6GSS7 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hist2h2aa1Q6GSS7 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hist2h2aa1Q6GSS7 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hist2h2aa1Q6GSS7 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hist2h2aa1Q6GSS7 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hist2h2aa1Q6GSS7 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hist2h2aa1Q6GSS7 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hist2h2aa1Q6GSS7 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Hist2h2aa1Q6GSS7 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hist2h2aa1Q6GSS7 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hist2h2aa1Q6GSS7 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hist2h2aa1Q6GSS7 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hist2h2aa1Q6GSS7 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hist2h2aa1Q6GSS7 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Hist2h2aa1Q6GSS7 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hist2h2aa1Q6GSS7 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Hist2h2aa1Q6GSS7 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hist2h2aa1Q6GSS7 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Hist2h2aa1Q6GSS7 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hist2h2aa1Q6GSS7 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Hist2h2aa1Q6GSS7 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hist2h2aa1Q6GSS7 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hist2h2aa1Q6GSS7 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hist2h2aa1Q6GSS7 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hist2h2aa1Q6GSS7 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hist2h2aa1Q6GSS7 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hist2h2aa1Q6GSS7 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hist2h2aa1Q6GSS7 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hist2h2aa1Q6GSS7 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hist2h2aa1Q6GSS7 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hist2h2aa1Q6GSS7 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hist2h2aa1Q6GSS7 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hist2h2aa1Q6GSS7 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hist2h2aa1Q6GSS7 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hist2h2aa1Q6GSS7 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hist2h2aa1Q6GSS7 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hist2h2aa1Q6GSS7 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hist2h2aa1Q6GSS7 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hist2h2aa1Q6GSS7 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hist2h2aa1Q6GSS7 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hist2h2aa1Q6GSS7 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hist2h2aa1Q6GSS7 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hist2h2aa1Q6GSS7 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hist2h2aa1Q6GSS7 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hist2h2aa1Q6GSS7 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hist2h2aa1Q6GSS7 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hist2h2aa1Q6GSS7 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hist2h2aa1Q6GSS7 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hist2h2aa1Q6GSS7 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hist2h2aa1Q6GSS7 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hist2h2aa1Q6GSS7 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hist2h2aa1Q6GSS7 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hist2h2aa1Q6GSS7 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hist2h2aa1Q6GSS7 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hist2h2aa1Q6GSS7 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hist2h2aa1Q6GSS7 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hist2h2aa1Q6GSS7 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hist2h2aa1Q6GSS7 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hist2h2aa1Q6GSS7 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hist2h2aa1Q6GSS7 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hist2h2aa1Q6GSS7 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hist2h2aa1Q6GSS7 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hist2h2aa1Q6GSS7 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hist2h2aa1Q6GSS7 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hist2h2aa1Q6GSS7 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hist2h2aa1Q6GSS7 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hist2h2aa1Q6GSS7 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hist2h2aa1Q6GSS7 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hist2h2aa1Q6GSS7 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms