Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW0

Guanine nucleotide exchange C9orf72 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6DFW0 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Q6DFW0 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Q6DFW0 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Q6DFW0 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Q6DFW0 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Q6DFW0 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Q6DFW0 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Q6DFW0 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Q6DFW0 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Q6DFW0 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Q6DFW0 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Q6DFW0 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Q6DFW0 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Q6DFW0 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Q6DFW0 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Q6DFW0 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Q6DFW0 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Q6DFW0 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Q6DFW0 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Q6DFW0 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Q6DFW0 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Q6DFW0 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Q6DFW0 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Q6DFW0 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Q6DFW0 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Q6DFW0 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Q6DFW0 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Q6DFW0 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Q6DFW0 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Q6DFW0 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Q6DFW0 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Q6DFW0 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Q6DFW0 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Q6DFW0 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Q6DFW0 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Q6DFW0 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Q6DFW0 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Q6DFW0 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Q6DFW0 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Q6DFW0 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Q6DFW0 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Q6DFW0 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Q6DFW0 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Q6DFW0 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Q6DFW0 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Q6DFW0 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Q6DFW0 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Q6DFW0 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Q6DFW0 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Q6DFW0 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Q6DFW0 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Q6DFW0 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Q6DFW0 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Q6DFW0 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Q6DFW0 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Q6DFW0 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Q6DFW0 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Q6DFW0 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Q6DFW0 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Q6DFW0 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Q6DFW0 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Q6DFW0 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Q6DFW0 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Q6DFW0 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Q6DFW0 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Q6DFW0 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Q6DFW0 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Q6DFW0 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Q6DFW0 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Q6DFW0 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Q6DFW0 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Q6DFW0 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Q6DFW0 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Q6DFW0 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Q6DFW0 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Q6DFW0 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Q6DFW0 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Q6DFW0 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Q6DFW0 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Q6DFW0 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Q6DFW0 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Q6DFW0 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Q6DFW0 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Q6DFW0 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Q6DFW0 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Q6DFW0 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Q6DFW0 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Q6DFW0 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Q6DFW0 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Q6DFW0 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Q6DFW0 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Q6DFW0 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Q6DFW0 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Q6DFW0 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Q6DFW0 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Q6DFW0 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Q6DFW0 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Q6DFW0 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Q6DFW0 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Q6DFW0 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms