Protein–RNA interactions for Protein: Q6BCL1

Pram1, PML-RARA-regulated adapter molecule 1, mousemouse

Predictions only

Length 675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pram1Q6BCL1 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pram1Q6BCL1 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pram1Q6BCL1 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pram1Q6BCL1 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pram1Q6BCL1 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pram1Q6BCL1 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pram1Q6BCL1 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pram1Q6BCL1 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pram1Q6BCL1 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pram1Q6BCL1 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pram1Q6BCL1 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pram1Q6BCL1 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pram1Q6BCL1 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pram1Q6BCL1 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Pram1Q6BCL1 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pram1Q6BCL1 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pram1Q6BCL1 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pram1Q6BCL1 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pram1Q6BCL1 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pram1Q6BCL1 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pram1Q6BCL1 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pram1Q6BCL1 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pram1Q6BCL1 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pram1Q6BCL1 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pram1Q6BCL1 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pram1Q6BCL1 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pram1Q6BCL1 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pram1Q6BCL1 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pram1Q6BCL1 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Pram1Q6BCL1 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pram1Q6BCL1 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pram1Q6BCL1 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pram1Q6BCL1 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pram1Q6BCL1 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pram1Q6BCL1 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pram1Q6BCL1 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pram1Q6BCL1 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pram1Q6BCL1 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pram1Q6BCL1 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pram1Q6BCL1 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pram1Q6BCL1 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pram1Q6BCL1 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pram1Q6BCL1 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pram1Q6BCL1 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pram1Q6BCL1 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pram1Q6BCL1 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pram1Q6BCL1 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pram1Q6BCL1 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pram1Q6BCL1 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pram1Q6BCL1 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pram1Q6BCL1 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pram1Q6BCL1 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pram1Q6BCL1 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pram1Q6BCL1 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pram1Q6BCL1 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pram1Q6BCL1 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pram1Q6BCL1 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pram1Q6BCL1 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pram1Q6BCL1 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pram1Q6BCL1 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pram1Q6BCL1 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pram1Q6BCL1 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pram1Q6BCL1 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pram1Q6BCL1 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pram1Q6BCL1 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pram1Q6BCL1 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pram1Q6BCL1 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pram1Q6BCL1 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pram1Q6BCL1 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pram1Q6BCL1 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pram1Q6BCL1 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pram1Q6BCL1 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Pram1Q6BCL1 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pram1Q6BCL1 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pram1Q6BCL1 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pram1Q6BCL1 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pram1Q6BCL1 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pram1Q6BCL1 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pram1Q6BCL1 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Pram1Q6BCL1 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pram1Q6BCL1 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pram1Q6BCL1 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pram1Q6BCL1 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pram1Q6BCL1 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pram1Q6BCL1 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pram1Q6BCL1 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pram1Q6BCL1 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Pram1Q6BCL1 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pram1Q6BCL1 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pram1Q6BCL1 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pram1Q6BCL1 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Pram1Q6BCL1 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pram1Q6BCL1 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pram1Q6BCL1 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pram1Q6BCL1 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pram1Q6BCL1 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Pram1Q6BCL1 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pram1Q6BCL1 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pram1Q6BCL1 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pram1Q6BCL1 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms