Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS0

Pdzrn3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, mousemouse

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Length 1,063 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzrn3Q69ZS0 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pdzrn3Q69ZS0 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pdzrn3Q69ZS0 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pdzrn3Q69ZS0 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pdzrn3Q69ZS0 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pdzrn3Q69ZS0 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pdzrn3Q69ZS0 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pdzrn3Q69ZS0 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pdzrn3Q69ZS0 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pdzrn3Q69ZS0 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Pdzrn3Q69ZS0 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pdzrn3Q69ZS0 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Pdzrn3Q69ZS0 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pdzrn3Q69ZS0 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pdzrn3Q69ZS0 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pdzrn3Q69ZS0 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pdzrn3Q69ZS0 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pdzrn3Q69ZS0 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pdzrn3Q69ZS0 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pdzrn3Q69ZS0 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pdzrn3Q69ZS0 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pdzrn3Q69ZS0 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pdzrn3Q69ZS0 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pdzrn3Q69ZS0 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pdzrn3Q69ZS0 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pdzrn3Q69ZS0 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pdzrn3Q69ZS0 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pdzrn3Q69ZS0 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pdzrn3Q69ZS0 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Pdzrn3Q69ZS0 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pdzrn3Q69ZS0 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pdzrn3Q69ZS0 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pdzrn3Q69ZS0 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pdzrn3Q69ZS0 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pdzrn3Q69ZS0 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pdzrn3Q69ZS0 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pdzrn3Q69ZS0 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pdzrn3Q69ZS0 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Pdzrn3Q69ZS0 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pdzrn3Q69ZS0 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pdzrn3Q69ZS0 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pdzrn3Q69ZS0 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Pdzrn3Q69ZS0 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pdzrn3Q69ZS0 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Pdzrn3Q69ZS0 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pdzrn3Q69ZS0 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Pdzrn3Q69ZS0 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Pdzrn3Q69ZS0 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pdzrn3Q69ZS0 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pdzrn3Q69ZS0 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pdzrn3Q69ZS0 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Pdzrn3Q69ZS0 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Pdzrn3Q69ZS0 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Pdzrn3Q69ZS0 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Pdzrn3Q69ZS0 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pdzrn3Q69ZS0 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Pdzrn3Q69ZS0 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pdzrn3Q69ZS0 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pdzrn3Q69ZS0 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pdzrn3Q69ZS0 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pdzrn3Q69ZS0 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pdzrn3Q69ZS0 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pdzrn3Q69ZS0 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pdzrn3Q69ZS0 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pdzrn3Q69ZS0 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pdzrn3Q69ZS0 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pdzrn3Q69ZS0 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pdzrn3Q69ZS0 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pdzrn3Q69ZS0 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pdzrn3Q69ZS0 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pdzrn3Q69ZS0 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pdzrn3Q69ZS0 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pdzrn3Q69ZS0 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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