Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE2

Atg9a, Autophagy-related protein 9A, mousemouse

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Length 551 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9aQ68FE2 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atg9aQ68FE2 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atg9aQ68FE2 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Atg9aQ68FE2 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atg9aQ68FE2 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atg9aQ68FE2 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atg9aQ68FE2 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atg9aQ68FE2 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atg9aQ68FE2 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atg9aQ68FE2 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atg9aQ68FE2 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atg9aQ68FE2 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atg9aQ68FE2 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atg9aQ68FE2 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atg9aQ68FE2 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Atg9aQ68FE2 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atg9aQ68FE2 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atg9aQ68FE2 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atg9aQ68FE2 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Atg9aQ68FE2 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atg9aQ68FE2 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atg9aQ68FE2 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Atg9aQ68FE2 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atg9aQ68FE2 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atg9aQ68FE2 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atg9aQ68FE2 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atg9aQ68FE2 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atg9aQ68FE2 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atg9aQ68FE2 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atg9aQ68FE2 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atg9aQ68FE2 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Atg9aQ68FE2 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atg9aQ68FE2 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atg9aQ68FE2 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atg9aQ68FE2 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atg9aQ68FE2 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atg9aQ68FE2 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Atg9aQ68FE2 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atg9aQ68FE2 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atg9aQ68FE2 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atg9aQ68FE2 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atg9aQ68FE2 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atg9aQ68FE2 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atg9aQ68FE2 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atg9aQ68FE2 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atg9aQ68FE2 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Atg9aQ68FE2 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Atg9aQ68FE2 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atg9aQ68FE2 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Atg9aQ68FE2 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atg9aQ68FE2 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Atg9aQ68FE2 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Atg9aQ68FE2 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Atg9aQ68FE2 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atg9aQ68FE2 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Atg9aQ68FE2 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atg9aQ68FE2 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atg9aQ68FE2 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atg9aQ68FE2 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atg9aQ68FE2 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Atg9aQ68FE2 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Atg9aQ68FE2 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atg9aQ68FE2 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atg9aQ68FE2 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atg9aQ68FE2 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atg9aQ68FE2 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atg9aQ68FE2 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atg9aQ68FE2 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atg9aQ68FE2 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atg9aQ68FE2 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atg9aQ68FE2 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atg9aQ68FE2 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atg9aQ68FE2 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atg9aQ68FE2 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atg9aQ68FE2 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atg9aQ68FE2 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atg9aQ68FE2 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atg9aQ68FE2 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atg9aQ68FE2 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Atg9aQ68FE2 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atg9aQ68FE2 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atg9aQ68FE2 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Atg9aQ68FE2 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Atg9aQ68FE2 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Atg9aQ68FE2 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atg9aQ68FE2 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atg9aQ68FE2 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atg9aQ68FE2 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atg9aQ68FE2 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Atg9aQ68FE2 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atg9aQ68FE2 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atg9aQ68FE2 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atg9aQ68FE2 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atg9aQ68FE2 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atg9aQ68FE2 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atg9aQ68FE2 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atg9aQ68FE2 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atg9aQ68FE2 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atg9aQ68FE2 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atg9aQ68FE2 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms