Protein–RNA interactions for Protein: Q67DU8

Clec4b2, Antigen presenting cell lectin-like receptor A1, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec4b2Q67DU8 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Clec4b2Q67DU8 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Clec4b2Q67DU8 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Clec4b2Q67DU8 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Clec4b2Q67DU8 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Clec4b2Q67DU8 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Clec4b2Q67DU8 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Clec4b2Q67DU8 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Clec4b2Q67DU8 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Clec4b2Q67DU8 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Clec4b2Q67DU8 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Clec4b2Q67DU8 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Clec4b2Q67DU8 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Clec4b2Q67DU8 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Clec4b2Q67DU8 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Clec4b2Q67DU8 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Clec4b2Q67DU8 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Clec4b2Q67DU8 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Clec4b2Q67DU8 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Clec4b2Q67DU8 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Clec4b2Q67DU8 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Clec4b2Q67DU8 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Clec4b2Q67DU8 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Clec4b2Q67DU8 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Clec4b2Q67DU8 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Clec4b2Q67DU8 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Clec4b2Q67DU8 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Clec4b2Q67DU8 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Clec4b2Q67DU8 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Clec4b2Q67DU8 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Clec4b2Q67DU8 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Clec4b2Q67DU8 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Clec4b2Q67DU8 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Clec4b2Q67DU8 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Clec4b2Q67DU8 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Clec4b2Q67DU8 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Clec4b2Q67DU8 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Clec4b2Q67DU8 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Clec4b2Q67DU8 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Clec4b2Q67DU8 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Clec4b2Q67DU8 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Clec4b2Q67DU8 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Clec4b2Q67DU8 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Clec4b2Q67DU8 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Clec4b2Q67DU8 Lvrn-201ENSMUST00000025358 3219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Clec4b2Q67DU8 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Clec4b2Q67DU8 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Clec4b2Q67DU8 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Clec4b2Q67DU8 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Clec4b2Q67DU8 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Clec4b2Q67DU8 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Clec4b2Q67DU8 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Clec4b2Q67DU8 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Clec4b2Q67DU8 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Clec4b2Q67DU8 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Clec4b2Q67DU8 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Clec4b2Q67DU8 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Clec4b2Q67DU8 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Clec4b2Q67DU8 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Clec4b2Q67DU8 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Clec4b2Q67DU8 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Clec4b2Q67DU8 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Clec4b2Q67DU8 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Clec4b2Q67DU8 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Clec4b2Q67DU8 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Clec4b2Q67DU8 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Clec4b2Q67DU8 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Clec4b2Q67DU8 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Clec4b2Q67DU8 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Clec4b2Q67DU8 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Clec4b2Q67DU8 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Clec4b2Q67DU8 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Clec4b2Q67DU8 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Clec4b2Q67DU8 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Clec4b2Q67DU8 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Clec4b2Q67DU8 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Clec4b2Q67DU8 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Clec4b2Q67DU8 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Clec4b2Q67DU8 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Clec4b2Q67DU8 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Clec4b2Q67DU8 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Clec4b2Q67DU8 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Clec4b2Q67DU8 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Clec4b2Q67DU8 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Clec4b2Q67DU8 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Clec4b2Q67DU8 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Clec4b2Q67DU8 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Clec4b2Q67DU8 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Clec4b2Q67DU8 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Clec4b2Q67DU8 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Clec4b2Q67DU8 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Clec4b2Q67DU8 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Clec4b2Q67DU8 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Clec4b2Q67DU8 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Clec4b2Q67DU8 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Clec4b2Q67DU8 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Clec4b2Q67DU8 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Clec4b2Q67DU8 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Clec4b2Q67DU8 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Clec4b2Q67DU8 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms