Protein–RNA interactions for Protein: Q66JT5

Tpgs2, Tubulin polyglutamylase complex subunit 2, mousemouse

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Length 296 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Tpgs2Q66JT5 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Tpgs2Q66JT5 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Tpgs2Q66JT5 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tpgs2Q66JT5 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tpgs2Q66JT5 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tpgs2Q66JT5 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tpgs2Q66JT5 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tpgs2Q66JT5 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tpgs2Q66JT5 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tpgs2Q66JT5 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tpgs2Q66JT5 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tpgs2Q66JT5 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tpgs2Q66JT5 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tpgs2Q66JT5 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tpgs2Q66JT5 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Tpgs2Q66JT5 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tpgs2Q66JT5 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tpgs2Q66JT5 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tpgs2Q66JT5 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Tpgs2Q66JT5 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Tpgs2Q66JT5 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tpgs2Q66JT5 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tpgs2Q66JT5 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tpgs2Q66JT5 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tpgs2Q66JT5 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tpgs2Q66JT5 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tpgs2Q66JT5 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tpgs2Q66JT5 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tpgs2Q66JT5 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tpgs2Q66JT5 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
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Tpgs2Q66JT5 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tpgs2Q66JT5 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tpgs2Q66JT5 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tpgs2Q66JT5 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tpgs2Q66JT5 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tpgs2Q66JT5 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tpgs2Q66JT5 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tpgs2Q66JT5 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tpgs2Q66JT5 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tpgs2Q66JT5 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Tpgs2Q66JT5 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tpgs2Q66JT5 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Tpgs2Q66JT5 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tpgs2Q66JT5 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Tpgs2Q66JT5 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tpgs2Q66JT5 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tpgs2Q66JT5 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Tpgs2Q66JT5 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tpgs2Q66JT5 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tpgs2Q66JT5 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tpgs2Q66JT5 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tpgs2Q66JT5 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tpgs2Q66JT5 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tpgs2Q66JT5 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tpgs2Q66JT5 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tpgs2Q66JT5 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tpgs2Q66JT5 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tpgs2Q66JT5 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tpgs2Q66JT5 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tpgs2Q66JT5 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Tpgs2Q66JT5 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms