Protein–RNA interactions for Protein: Q62255

Sall3, Sal-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall3Q62255 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
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Sall3Q62255 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sall3Q62255 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Sall3Q62255 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sall3Q62255 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sall3Q62255 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sall3Q62255 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sall3Q62255 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sall3Q62255 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Sall3Q62255 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sall3Q62255 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sall3Q62255 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sall3Q62255 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sall3Q62255 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sall3Q62255 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sall3Q62255 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sall3Q62255 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sall3Q62255 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sall3Q62255 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sall3Q62255 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sall3Q62255 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sall3Q62255 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sall3Q62255 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sall3Q62255 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sall3Q62255 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sall3Q62255 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sall3Q62255 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sall3Q62255 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sall3Q62255 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sall3Q62255 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sall3Q62255 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sall3Q62255 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sall3Q62255 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sall3Q62255 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sall3Q62255 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sall3Q62255 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Sall3Q62255 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Sall3Q62255 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Sall3Q62255 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sall3Q62255 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sall3Q62255 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sall3Q62255 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sall3Q62255 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sall3Q62255 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sall3Q62255 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sall3Q62255 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sall3Q62255 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sall3Q62255 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sall3Q62255 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sall3Q62255 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Sall3Q62255 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sall3Q62255 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sall3Q62255 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sall3Q62255 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Sall3Q62255 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sall3Q62255 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
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Sall3Q62255 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Sall3Q62255 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sall3Q62255 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sall3Q62255 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sall3Q62255 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
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Sall3Q62255 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
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Sall3Q62255 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sall3Q62255 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sall3Q62255 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sall3Q62255 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sall3Q62255 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sall3Q62255 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sall3Q62255 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sall3Q62255 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sall3Q62255 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sall3Q62255 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sall3Q62255 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sall3Q62255 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sall3Q62255 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Sall3Q62255 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sall3Q62255 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sall3Q62255 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sall3Q62255 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sall3Q62255 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sall3Q62255 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sall3Q62255 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sall3Q62255 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sall3Q62255 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sall3Q62255 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sall3Q62255 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sall3Q62255 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
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