Protein–RNA interactions for Protein: Q62209

Sycp1, Synaptonemal complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp1Q62209 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sycp1Q62209 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sycp1Q62209 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sycp1Q62209 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sycp1Q62209 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sycp1Q62209 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sycp1Q62209 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sycp1Q62209 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sycp1Q62209 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sycp1Q62209 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sycp1Q62209 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sycp1Q62209 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sycp1Q62209 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sycp1Q62209 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sycp1Q62209 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sycp1Q62209 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sycp1Q62209 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sycp1Q62209 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sycp1Q62209 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sycp1Q62209 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Sycp1Q62209 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sycp1Q62209 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sycp1Q62209 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Sycp1Q62209 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sycp1Q62209 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sycp1Q62209 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sycp1Q62209 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sycp1Q62209 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sycp1Q62209 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sycp1Q62209 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sycp1Q62209 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sycp1Q62209 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sycp1Q62209 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sycp1Q62209 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sycp1Q62209 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sycp1Q62209 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sycp1Q62209 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sycp1Q62209 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sycp1Q62209 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sycp1Q62209 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sycp1Q62209 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sycp1Q62209 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sycp1Q62209 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sycp1Q62209 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sycp1Q62209 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sycp1Q62209 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sycp1Q62209 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sycp1Q62209 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sycp1Q62209 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Sycp1Q62209 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sycp1Q62209 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sycp1Q62209 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Sycp1Q62209 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sycp1Q62209 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sycp1Q62209 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sycp1Q62209 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sycp1Q62209 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sycp1Q62209 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sycp1Q62209 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sycp1Q62209 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sycp1Q62209 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sycp1Q62209 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sycp1Q62209 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sycp1Q62209 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sycp1Q62209 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sycp1Q62209 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sycp1Q62209 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sycp1Q62209 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sycp1Q62209 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sycp1Q62209 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sycp1Q62209 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sycp1Q62209 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sycp1Q62209 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Sycp1Q62209 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sycp1Q62209 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sycp1Q62209 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sycp1Q62209 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sycp1Q62209 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sycp1Q62209 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sycp1Q62209 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sycp1Q62209 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sycp1Q62209 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Sycp1Q62209 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sycp1Q62209 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Sycp1Q62209 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Sycp1Q62209 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sycp1Q62209 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sycp1Q62209 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Sycp1Q62209 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Sycp1Q62209 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Sycp1Q62209 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Sycp1Q62209 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sycp1Q62209 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sycp1Q62209 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sycp1Q62209 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sycp1Q62209 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sycp1Q62209 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sycp1Q62209 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sycp1Q62209 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sycp1Q62209 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.4 ms