Protein–RNA interactions for Protein: Q61644

Pacsin1, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin1Q61644 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pacsin1Q61644 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pacsin1Q61644 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pacsin1Q61644 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pacsin1Q61644 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pacsin1Q61644 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pacsin1Q61644 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pacsin1Q61644 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Pacsin1Q61644 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Pacsin1Q61644 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pacsin1Q61644 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pacsin1Q61644 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Pacsin1Q61644 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Pacsin1Q61644 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pacsin1Q61644 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pacsin1Q61644 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pacsin1Q61644 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pacsin1Q61644 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pacsin1Q61644 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pacsin1Q61644 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pacsin1Q61644 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pacsin1Q61644 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pacsin1Q61644 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pacsin1Q61644 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pacsin1Q61644 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pacsin1Q61644 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pacsin1Q61644 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pacsin1Q61644 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pacsin1Q61644 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pacsin1Q61644 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pacsin1Q61644 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pacsin1Q61644 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pacsin1Q61644 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pacsin1Q61644 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pacsin1Q61644 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Pacsin1Q61644 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pacsin1Q61644 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pacsin1Q61644 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pacsin1Q61644 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pacsin1Q61644 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pacsin1Q61644 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pacsin1Q61644 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pacsin1Q61644 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pacsin1Q61644 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pacsin1Q61644 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pacsin1Q61644 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pacsin1Q61644 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Pacsin1Q61644 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Pacsin1Q61644 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pacsin1Q61644 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pacsin1Q61644 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pacsin1Q61644 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pacsin1Q61644 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pacsin1Q61644 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pacsin1Q61644 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pacsin1Q61644 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pacsin1Q61644 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pacsin1Q61644 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pacsin1Q61644 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pacsin1Q61644 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pacsin1Q61644 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pacsin1Q61644 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pacsin1Q61644 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pacsin1Q61644 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pacsin1Q61644 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pacsin1Q61644 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pacsin1Q61644 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pacsin1Q61644 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pacsin1Q61644 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pacsin1Q61644 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pacsin1Q61644 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pacsin1Q61644 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pacsin1Q61644 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Pacsin1Q61644 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pacsin1Q61644 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pacsin1Q61644 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Pacsin1Q61644 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pacsin1Q61644 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Pacsin1Q61644 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pacsin1Q61644 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pacsin1Q61644 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pacsin1Q61644 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pacsin1Q61644 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pacsin1Q61644 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pacsin1Q61644 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pacsin1Q61644 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pacsin1Q61644 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pacsin1Q61644 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pacsin1Q61644 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Pacsin1Q61644 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pacsin1Q61644 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pacsin1Q61644 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pacsin1Q61644 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pacsin1Q61644 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pacsin1Q61644 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pacsin1Q61644 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pacsin1Q61644 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pacsin1Q61644 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pacsin1Q61644 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Pacsin1Q61644 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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