Protein–RNA interactions for Protein: Q61045

Sim1, Single-minded homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 765 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sim1Q61045 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sim1Q61045 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sim1Q61045 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sim1Q61045 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sim1Q61045 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sim1Q61045 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Sim1Q61045 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sim1Q61045 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sim1Q61045 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sim1Q61045 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sim1Q61045 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sim1Q61045 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sim1Q61045 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sim1Q61045 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sim1Q61045 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sim1Q61045 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sim1Q61045 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sim1Q61045 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sim1Q61045 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Sim1Q61045 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sim1Q61045 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sim1Q61045 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sim1Q61045 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sim1Q61045 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sim1Q61045 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sim1Q61045 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sim1Q61045 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sim1Q61045 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sim1Q61045 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sim1Q61045 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sim1Q61045 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sim1Q61045 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sim1Q61045 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sim1Q61045 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sim1Q61045 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sim1Q61045 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sim1Q61045 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sim1Q61045 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Sim1Q61045 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sim1Q61045 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sim1Q61045 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sim1Q61045 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sim1Q61045 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sim1Q61045 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Sim1Q61045 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sim1Q61045 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Sim1Q61045 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sim1Q61045 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Sim1Q61045 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sim1Q61045 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Sim1Q61045 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sim1Q61045 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sim1Q61045 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sim1Q61045 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sim1Q61045 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sim1Q61045 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sim1Q61045 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sim1Q61045 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sim1Q61045 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sim1Q61045 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sim1Q61045 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sim1Q61045 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sim1Q61045 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sim1Q61045 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sim1Q61045 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sim1Q61045 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sim1Q61045 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sim1Q61045 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sim1Q61045 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sim1Q61045 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sim1Q61045 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sim1Q61045 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sim1Q61045 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sim1Q61045 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sim1Q61045 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sim1Q61045 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Sim1Q61045 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sim1Q61045 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sim1Q61045 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Sim1Q61045 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sim1Q61045 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sim1Q61045 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sim1Q61045 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Sim1Q61045 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sim1Q61045 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Sim1Q61045 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sim1Q61045 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sim1Q61045 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sim1Q61045 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sim1Q61045 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sim1Q61045 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sim1Q61045 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sim1Q61045 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sim1Q61045 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sim1Q61045 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sim1Q61045 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sim1Q61045 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sim1Q61045 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Sim1Q61045 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sim1Q61045 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms