Protein–RNA interactions for Protein: Q60857

Slc6a4, Sodium-dependent serotonin transporter, mousemouse

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Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a4Q60857 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Slc6a4Q60857 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Slc6a4Q60857 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Slc6a4Q60857 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Slc6a4Q60857 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Slc6a4Q60857 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Slc6a4Q60857 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Slc6a4Q60857 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Slc6a4Q60857 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Slc6a4Q60857 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Slc6a4Q60857 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Slc6a4Q60857 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Slc6a4Q60857 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Slc6a4Q60857 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Slc6a4Q60857 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Slc6a4Q60857 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Slc6a4Q60857 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Slc6a4Q60857 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Slc6a4Q60857 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Slc6a4Q60857 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Slc6a4Q60857 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Slc6a4Q60857 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Slc6a4Q60857 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Slc6a4Q60857 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Slc6a4Q60857 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Slc6a4Q60857 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Slc6a4Q60857 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Slc6a4Q60857 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Slc6a4Q60857 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Slc6a4Q60857 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Slc6a4Q60857 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Slc6a4Q60857 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Slc6a4Q60857 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Slc6a4Q60857 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Slc6a4Q60857 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Slc6a4Q60857 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Slc6a4Q60857 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Slc6a4Q60857 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Slc6a4Q60857 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Slc6a4Q60857 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Slc6a4Q60857 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Slc6a4Q60857 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Slc6a4Q60857 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Slc6a4Q60857 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Slc6a4Q60857 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Slc6a4Q60857 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Slc6a4Q60857 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Slc6a4Q60857 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Slc6a4Q60857 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Slc6a4Q60857 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Slc6a4Q60857 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Slc6a4Q60857 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Slc6a4Q60857 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Slc6a4Q60857 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Slc6a4Q60857 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Slc6a4Q60857 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Slc6a4Q60857 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Slc6a4Q60857 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Slc6a4Q60857 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Slc6a4Q60857 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Slc6a4Q60857 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Slc6a4Q60857 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Slc6a4Q60857 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Slc6a4Q60857 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Slc6a4Q60857 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Slc6a4Q60857 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Slc6a4Q60857 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Slc6a4Q60857 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Slc6a4Q60857 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Slc6a4Q60857 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Slc6a4Q60857 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Slc6a4Q60857 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Slc6a4Q60857 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Slc6a4Q60857 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Slc6a4Q60857 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Slc6a4Q60857 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Slc6a4Q60857 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Slc6a4Q60857 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Slc6a4Q60857 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Slc6a4Q60857 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Slc6a4Q60857 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Slc6a4Q60857 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Slc6a4Q60857 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Slc6a4Q60857 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Slc6a4Q60857 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Slc6a4Q60857 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Slc6a4Q60857 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Slc6a4Q60857 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Slc6a4Q60857 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Slc6a4Q60857 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Slc6a4Q60857 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Slc6a4Q60857 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Slc6a4Q60857 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Slc6a4Q60857 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Slc6a4Q60857 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Slc6a4Q60857 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Slc6a4Q60857 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Slc6a4Q60857 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Slc6a4Q60857 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Slc6a4Q60857 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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