Protein–RNA interactions for Protein: Q60710

Samhd1, Deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase SAMHD1, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samhd1Q60710 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Samhd1Q60710 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Samhd1Q60710 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Samhd1Q60710 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Samhd1Q60710 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Samhd1Q60710 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Samhd1Q60710 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Samhd1Q60710 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Samhd1Q60710 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Samhd1Q60710 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Samhd1Q60710 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Samhd1Q60710 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Samhd1Q60710 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Samhd1Q60710 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Samhd1Q60710 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Samhd1Q60710 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Samhd1Q60710 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Samhd1Q60710 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Samhd1Q60710 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Samhd1Q60710 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Samhd1Q60710 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Samhd1Q60710 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Samhd1Q60710 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Samhd1Q60710 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Samhd1Q60710 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Samhd1Q60710 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Samhd1Q60710 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Samhd1Q60710 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Samhd1Q60710 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Samhd1Q60710 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Samhd1Q60710 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Samhd1Q60710 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Samhd1Q60710 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Samhd1Q60710 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Samhd1Q60710 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Samhd1Q60710 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Samhd1Q60710 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Samhd1Q60710 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Samhd1Q60710 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Samhd1Q60710 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Samhd1Q60710 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Samhd1Q60710 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Samhd1Q60710 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Samhd1Q60710 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Samhd1Q60710 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Samhd1Q60710 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Samhd1Q60710 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Samhd1Q60710 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Samhd1Q60710 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Samhd1Q60710 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Samhd1Q60710 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Samhd1Q60710 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Samhd1Q60710 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Samhd1Q60710 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Samhd1Q60710 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Samhd1Q60710 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Samhd1Q60710 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Samhd1Q60710 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Samhd1Q60710 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Samhd1Q60710 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Samhd1Q60710 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Samhd1Q60710 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Samhd1Q60710 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Samhd1Q60710 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Samhd1Q60710 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Samhd1Q60710 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Samhd1Q60710 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Samhd1Q60710 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Samhd1Q60710 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Samhd1Q60710 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Samhd1Q60710 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Samhd1Q60710 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Samhd1Q60710 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Samhd1Q60710 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Samhd1Q60710 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Samhd1Q60710 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Samhd1Q60710 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Samhd1Q60710 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Samhd1Q60710 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Samhd1Q60710 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Samhd1Q60710 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Samhd1Q60710 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Samhd1Q60710 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Samhd1Q60710 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Samhd1Q60710 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Samhd1Q60710 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Samhd1Q60710 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Samhd1Q60710 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Samhd1Q60710 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Samhd1Q60710 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Samhd1Q60710 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Samhd1Q60710 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Samhd1Q60710 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Samhd1Q60710 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Samhd1Q60710 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Samhd1Q60710 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Samhd1Q60710 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Samhd1Q60710 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Samhd1Q60710 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Samhd1Q60710 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms