Protein–RNA interactions for Protein: Q60698

Ski, Ski oncogene, mousemouse

Predictions only

Length 725 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SkiQ60698 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SkiQ60698 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SkiQ60698 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SkiQ60698 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SkiQ60698 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SkiQ60698 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SkiQ60698 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SkiQ60698 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SkiQ60698 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SkiQ60698 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SkiQ60698 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SkiQ60698 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SkiQ60698 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SkiQ60698 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SkiQ60698 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SkiQ60698 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SkiQ60698 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SkiQ60698 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SkiQ60698 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SkiQ60698 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SkiQ60698 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SkiQ60698 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SkiQ60698 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SkiQ60698 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SkiQ60698 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SkiQ60698 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SkiQ60698 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SkiQ60698 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SkiQ60698 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SkiQ60698 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SkiQ60698 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SkiQ60698 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SkiQ60698 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SkiQ60698 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SkiQ60698 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SkiQ60698 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SkiQ60698 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SkiQ60698 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SkiQ60698 A430010J10Rik-201ENSMUST00000054470 408 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SkiQ60698 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SkiQ60698 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SkiQ60698 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SkiQ60698 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SkiQ60698 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SkiQ60698 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SkiQ60698 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SkiQ60698 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SkiQ60698 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SkiQ60698 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SkiQ60698 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SkiQ60698 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SkiQ60698 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SkiQ60698 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SkiQ60698 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SkiQ60698 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SkiQ60698 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SkiQ60698 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SkiQ60698 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SkiQ60698 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SkiQ60698 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SkiQ60698 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SkiQ60698 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SkiQ60698 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SkiQ60698 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SkiQ60698 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SkiQ60698 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SkiQ60698 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SkiQ60698 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SkiQ60698 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SkiQ60698 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SkiQ60698 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SkiQ60698 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SkiQ60698 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SkiQ60698 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SkiQ60698 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SkiQ60698 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SkiQ60698 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SkiQ60698 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SkiQ60698 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SkiQ60698 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SkiQ60698 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SkiQ60698 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SkiQ60698 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SkiQ60698 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SkiQ60698 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SkiQ60698 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SkiQ60698 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SkiQ60698 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SkiQ60698 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SkiQ60698 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SkiQ60698 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SkiQ60698 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SkiQ60698 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SkiQ60698 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SkiQ60698 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SkiQ60698 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SkiQ60698 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SkiQ60698 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SkiQ60698 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SkiQ60698 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms