Protein–RNA interactions for Protein: Q60636

Prdm1, PR domain zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm1Q60636 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prdm1Q60636 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prdm1Q60636 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Prdm1Q60636 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Prdm1Q60636 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Prdm1Q60636 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prdm1Q60636 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prdm1Q60636 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prdm1Q60636 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prdm1Q60636 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prdm1Q60636 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prdm1Q60636 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prdm1Q60636 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prdm1Q60636 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prdm1Q60636 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prdm1Q60636 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prdm1Q60636 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prdm1Q60636 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prdm1Q60636 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prdm1Q60636 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prdm1Q60636 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prdm1Q60636 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prdm1Q60636 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prdm1Q60636 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prdm1Q60636 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Prdm1Q60636 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prdm1Q60636 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Prdm1Q60636 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prdm1Q60636 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Prdm1Q60636 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prdm1Q60636 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prdm1Q60636 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prdm1Q60636 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prdm1Q60636 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prdm1Q60636 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prdm1Q60636 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prdm1Q60636 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prdm1Q60636 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prdm1Q60636 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prdm1Q60636 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prdm1Q60636 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prdm1Q60636 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prdm1Q60636 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Prdm1Q60636 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prdm1Q60636 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prdm1Q60636 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prdm1Q60636 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prdm1Q60636 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prdm1Q60636 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prdm1Q60636 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prdm1Q60636 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prdm1Q60636 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prdm1Q60636 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prdm1Q60636 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prdm1Q60636 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prdm1Q60636 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prdm1Q60636 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Prdm1Q60636 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prdm1Q60636 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prdm1Q60636 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Prdm1Q60636 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prdm1Q60636 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Prdm1Q60636 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prdm1Q60636 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prdm1Q60636 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prdm1Q60636 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Prdm1Q60636 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Prdm1Q60636 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prdm1Q60636 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prdm1Q60636 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prdm1Q60636 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prdm1Q60636 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prdm1Q60636 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prdm1Q60636 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prdm1Q60636 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prdm1Q60636 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prdm1Q60636 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prdm1Q60636 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prdm1Q60636 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prdm1Q60636 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prdm1Q60636 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prdm1Q60636 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prdm1Q60636 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prdm1Q60636 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prdm1Q60636 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prdm1Q60636 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prdm1Q60636 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prdm1Q60636 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prdm1Q60636 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prdm1Q60636 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prdm1Q60636 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Prdm1Q60636 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prdm1Q60636 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prdm1Q60636 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prdm1Q60636 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Prdm1Q60636 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prdm1Q60636 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prdm1Q60636 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prdm1Q60636 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prdm1Q60636 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms