Protein–RNA interactions for Protein: Q5XPI3

Rnf123, E3 ubiquitin-protein ligase RNF123, mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf123Q5XPI3 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf123Q5XPI3 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf123Q5XPI3 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf123Q5XPI3 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf123Q5XPI3 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf123Q5XPI3 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf123Q5XPI3 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf123Q5XPI3 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf123Q5XPI3 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf123Q5XPI3 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf123Q5XPI3 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf123Q5XPI3 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf123Q5XPI3 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf123Q5XPI3 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf123Q5XPI3 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf123Q5XPI3 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf123Q5XPI3 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf123Q5XPI3 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf123Q5XPI3 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf123Q5XPI3 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf123Q5XPI3 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf123Q5XPI3 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf123Q5XPI3 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf123Q5XPI3 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf123Q5XPI3 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf123Q5XPI3 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rnf123Q5XPI3 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rnf123Q5XPI3 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rnf123Q5XPI3 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rnf123Q5XPI3 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rnf123Q5XPI3 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rnf123Q5XPI3 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rnf123Q5XPI3 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rnf123Q5XPI3 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rnf123Q5XPI3 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rnf123Q5XPI3 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rnf123Q5XPI3 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Rnf123Q5XPI3 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rnf123Q5XPI3 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rnf123Q5XPI3 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rnf123Q5XPI3 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf123Q5XPI3 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf123Q5XPI3 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf123Q5XPI3 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf123Q5XPI3 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf123Q5XPI3 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf123Q5XPI3 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf123Q5XPI3 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf123Q5XPI3 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf123Q5XPI3 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf123Q5XPI3 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf123Q5XPI3 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf123Q5XPI3 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf123Q5XPI3 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf123Q5XPI3 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf123Q5XPI3 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf123Q5XPI3 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf123Q5XPI3 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf123Q5XPI3 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf123Q5XPI3 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf123Q5XPI3 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf123Q5XPI3 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf123Q5XPI3 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf123Q5XPI3 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf123Q5XPI3 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf123Q5XPI3 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf123Q5XPI3 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf123Q5XPI3 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf123Q5XPI3 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf123Q5XPI3 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf123Q5XPI3 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf123Q5XPI3 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf123Q5XPI3 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf123Q5XPI3 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf123Q5XPI3 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf123Q5XPI3 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf123Q5XPI3 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf123Q5XPI3 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf123Q5XPI3 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf123Q5XPI3 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf123Q5XPI3 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf123Q5XPI3 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf123Q5XPI3 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf123Q5XPI3 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf123Q5XPI3 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf123Q5XPI3 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf123Q5XPI3 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf123Q5XPI3 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf123Q5XPI3 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf123Q5XPI3 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf123Q5XPI3 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf123Q5XPI3 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf123Q5XPI3 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf123Q5XPI3 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf123Q5XPI3 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf123Q5XPI3 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf123Q5XPI3 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf123Q5XPI3 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf123Q5XPI3 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf123Q5XPI3 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms