Protein–RNA interactions for Protein: Q5SX40

Myh1, Myosin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,942 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myh1Q5SX40 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Myh1Q5SX40 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Myh1Q5SX40 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Myh1Q5SX40 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Myh1Q5SX40 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Myh1Q5SX40 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Myh1Q5SX40 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Myh1Q5SX40 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Myh1Q5SX40 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Myh1Q5SX40 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Myh1Q5SX40 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Myh1Q5SX40 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Myh1Q5SX40 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Myh1Q5SX40 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Myh1Q5SX40 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Myh1Q5SX40 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Myh1Q5SX40 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Myh1Q5SX40 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Myh1Q5SX40 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Myh1Q5SX40 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Myh1Q5SX40 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Myh1Q5SX40 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Myh1Q5SX40 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Myh1Q5SX40 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Myh1Q5SX40 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Myh1Q5SX40 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Myh1Q5SX40 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Myh1Q5SX40 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Myh1Q5SX40 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Myh1Q5SX40 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Myh1Q5SX40 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Myh1Q5SX40 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Myh1Q5SX40 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Myh1Q5SX40 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Myh1Q5SX40 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Myh1Q5SX40 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Myh1Q5SX40 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Myh1Q5SX40 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Myh1Q5SX40 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Myh1Q5SX40 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Myh1Q5SX40 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Myh1Q5SX40 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Myh1Q5SX40 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Myh1Q5SX40 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Myh1Q5SX40 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Myh1Q5SX40 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Myh1Q5SX40 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Myh1Q5SX40 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Myh1Q5SX40 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Myh1Q5SX40 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Myh1Q5SX40 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Myh1Q5SX40 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Myh1Q5SX40 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Myh1Q5SX40 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Myh1Q5SX40 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Myh1Q5SX40 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Myh1Q5SX40 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Myh1Q5SX40 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Myh1Q5SX40 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Myh1Q5SX40 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Myh1Q5SX40 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Myh1Q5SX40 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Myh1Q5SX40 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Myh1Q5SX40 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Myh1Q5SX40 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Myh1Q5SX40 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Myh1Q5SX40 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Myh1Q5SX40 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Myh1Q5SX40 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Myh1Q5SX40 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Myh1Q5SX40 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Myh1Q5SX40 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Myh1Q5SX40 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Myh1Q5SX40 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Myh1Q5SX40 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Myh1Q5SX40 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Myh1Q5SX40 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Myh1Q5SX40 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Myh1Q5SX40 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Myh1Q5SX40 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Myh1Q5SX40 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Myh1Q5SX40 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Myh1Q5SX40 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Myh1Q5SX40 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Myh1Q5SX40 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Myh1Q5SX40 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Myh1Q5SX40 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Myh1Q5SX40 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Myh1Q5SX40 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Myh1Q5SX40 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Myh1Q5SX40 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Myh1Q5SX40 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Myh1Q5SX40 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Myh1Q5SX40 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Myh1Q5SX40 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Myh1Q5SX40 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Myh1Q5SX40 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Myh1Q5SX40 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Myh1Q5SX40 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Myh1Q5SX40 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms