Protein–RNA interactions for Protein: Q5SQY2

Bod1, Biorientation of chromosomes in cell division protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bod1Q5SQY2 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Bod1Q5SQY2 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Bod1Q5SQY2 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Bod1Q5SQY2 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Bod1Q5SQY2 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Bod1Q5SQY2 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Bod1Q5SQY2 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Bod1Q5SQY2 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Bod1Q5SQY2 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Bod1Q5SQY2 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Bod1Q5SQY2 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Bod1Q5SQY2 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Bod1Q5SQY2 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Bod1Q5SQY2 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Bod1Q5SQY2 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Bod1Q5SQY2 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Bod1Q5SQY2 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Bod1Q5SQY2 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Bod1Q5SQY2 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Bod1Q5SQY2 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Bod1Q5SQY2 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Bod1Q5SQY2 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Bod1Q5SQY2 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Bod1Q5SQY2 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Bod1Q5SQY2 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Bod1Q5SQY2 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Bod1Q5SQY2 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Bod1Q5SQY2 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Bod1Q5SQY2 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Bod1Q5SQY2 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Bod1Q5SQY2 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Bod1Q5SQY2 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Bod1Q5SQY2 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Bod1Q5SQY2 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Bod1Q5SQY2 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Bod1Q5SQY2 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Bod1Q5SQY2 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Bod1Q5SQY2 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Bod1Q5SQY2 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Bod1Q5SQY2 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Bod1Q5SQY2 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Bod1Q5SQY2 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Bod1Q5SQY2 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Bod1Q5SQY2 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC12.21□□□□□ -0.46
Bod1Q5SQY2 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Bod1Q5SQY2 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Bod1Q5SQY2 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Bod1Q5SQY2 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Bod1Q5SQY2 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Bod1Q5SQY2 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Bod1Q5SQY2 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Bod1Q5SQY2 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Bod1Q5SQY2 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Bod1Q5SQY2 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Bod1Q5SQY2 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Bod1Q5SQY2 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Bod1Q5SQY2 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Bod1Q5SQY2 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Bod1Q5SQY2 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Bod1Q5SQY2 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Bod1Q5SQY2 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Bod1Q5SQY2 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Bod1Q5SQY2 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Bod1Q5SQY2 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Bod1Q5SQY2 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Bod1Q5SQY2 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Bod1Q5SQY2 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Bod1Q5SQY2 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Bod1Q5SQY2 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Bod1Q5SQY2 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Bod1Q5SQY2 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Bod1Q5SQY2 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Bod1Q5SQY2 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Bod1Q5SQY2 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Bod1Q5SQY2 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Bod1Q5SQY2 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Bod1Q5SQY2 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Bod1Q5SQY2 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Bod1Q5SQY2 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Bod1Q5SQY2 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Bod1Q5SQY2 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Bod1Q5SQY2 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Bod1Q5SQY2 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Bod1Q5SQY2 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Bod1Q5SQY2 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Bod1Q5SQY2 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Bod1Q5SQY2 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Bod1Q5SQY2 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Bod1Q5SQY2 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Bod1Q5SQY2 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Bod1Q5SQY2 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Bod1Q5SQY2 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Bod1Q5SQY2 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Bod1Q5SQY2 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Bod1Q5SQY2 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Bod1Q5SQY2 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Bod1Q5SQY2 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Bod1Q5SQY2 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Bod1Q5SQY2 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Bod1Q5SQY2 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms