Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL14

Trappc3l, Trafficking protein particle complex subunit 3-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3lQ4KL14 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trappc3lQ4KL14 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trappc3lQ4KL14 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Trappc3lQ4KL14 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Trappc3lQ4KL14 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trappc3lQ4KL14 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trappc3lQ4KL14 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Trappc3lQ4KL14 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Trappc3lQ4KL14 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trappc3lQ4KL14 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trappc3lQ4KL14 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Trappc3lQ4KL14 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trappc3lQ4KL14 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trappc3lQ4KL14 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trappc3lQ4KL14 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trappc3lQ4KL14 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trappc3lQ4KL14 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trappc3lQ4KL14 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trappc3lQ4KL14 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trappc3lQ4KL14 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trappc3lQ4KL14 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trappc3lQ4KL14 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trappc3lQ4KL14 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trappc3lQ4KL14 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trappc3lQ4KL14 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Trappc3lQ4KL14 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trappc3lQ4KL14 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Trappc3lQ4KL14 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trappc3lQ4KL14 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trappc3lQ4KL14 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trappc3lQ4KL14 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trappc3lQ4KL14 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trappc3lQ4KL14 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trappc3lQ4KL14 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trappc3lQ4KL14 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trappc3lQ4KL14 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trappc3lQ4KL14 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trappc3lQ4KL14 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Trappc3lQ4KL14 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Trappc3lQ4KL14 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trappc3lQ4KL14 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trappc3lQ4KL14 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trappc3lQ4KL14 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Trappc3lQ4KL14 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trappc3lQ4KL14 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trappc3lQ4KL14 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trappc3lQ4KL14 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trappc3lQ4KL14 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trappc3lQ4KL14 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Trappc3lQ4KL14 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trappc3lQ4KL14 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Trappc3lQ4KL14 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Trappc3lQ4KL14 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trappc3lQ4KL14 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Trappc3lQ4KL14 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trappc3lQ4KL14 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trappc3lQ4KL14 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trappc3lQ4KL14 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trappc3lQ4KL14 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Trappc3lQ4KL14 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trappc3lQ4KL14 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trappc3lQ4KL14 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trappc3lQ4KL14 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trappc3lQ4KL14 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trappc3lQ4KL14 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trappc3lQ4KL14 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trappc3lQ4KL14 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trappc3lQ4KL14 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trappc3lQ4KL14 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trappc3lQ4KL14 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trappc3lQ4KL14 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trappc3lQ4KL14 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trappc3lQ4KL14 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trappc3lQ4KL14 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trappc3lQ4KL14 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trappc3lQ4KL14 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Trappc3lQ4KL14 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trappc3lQ4KL14 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trappc3lQ4KL14 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trappc3lQ4KL14 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trappc3lQ4KL14 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trappc3lQ4KL14 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trappc3lQ4KL14 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Trappc3lQ4KL14 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trappc3lQ4KL14 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Trappc3lQ4KL14 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Trappc3lQ4KL14 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trappc3lQ4KL14 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trappc3lQ4KL14 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Trappc3lQ4KL14 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trappc3lQ4KL14 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trappc3lQ4KL14 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Trappc3lQ4KL14 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trappc3lQ4KL14 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Trappc3lQ4KL14 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trappc3lQ4KL14 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Trappc3lQ4KL14 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trappc3lQ4KL14 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trappc3lQ4KL14 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trappc3lQ4KL14 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms