Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3Q7

Pacs2, Phosphofurin acidic cluster sorting protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 862 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacs2Q3V3Q7 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pacs2Q3V3Q7 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pacs2Q3V3Q7 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pacs2Q3V3Q7 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pacs2Q3V3Q7 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pacs2Q3V3Q7 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pacs2Q3V3Q7 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pacs2Q3V3Q7 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pacs2Q3V3Q7 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pacs2Q3V3Q7 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pacs2Q3V3Q7 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pacs2Q3V3Q7 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pacs2Q3V3Q7 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pacs2Q3V3Q7 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Pacs2Q3V3Q7 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pacs2Q3V3Q7 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pacs2Q3V3Q7 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pacs2Q3V3Q7 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pacs2Q3V3Q7 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Pacs2Q3V3Q7 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Pacs2Q3V3Q7 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pacs2Q3V3Q7 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pacs2Q3V3Q7 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Pacs2Q3V3Q7 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pacs2Q3V3Q7 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pacs2Q3V3Q7 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pacs2Q3V3Q7 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pacs2Q3V3Q7 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pacs2Q3V3Q7 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pacs2Q3V3Q7 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pacs2Q3V3Q7 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pacs2Q3V3Q7 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pacs2Q3V3Q7 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pacs2Q3V3Q7 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pacs2Q3V3Q7 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pacs2Q3V3Q7 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pacs2Q3V3Q7 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pacs2Q3V3Q7 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pacs2Q3V3Q7 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pacs2Q3V3Q7 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pacs2Q3V3Q7 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pacs2Q3V3Q7 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pacs2Q3V3Q7 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pacs2Q3V3Q7 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pacs2Q3V3Q7 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Pacs2Q3V3Q7 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pacs2Q3V3Q7 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pacs2Q3V3Q7 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pacs2Q3V3Q7 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pacs2Q3V3Q7 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pacs2Q3V3Q7 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pacs2Q3V3Q7 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Pacs2Q3V3Q7 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pacs2Q3V3Q7 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pacs2Q3V3Q7 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pacs2Q3V3Q7 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pacs2Q3V3Q7 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pacs2Q3V3Q7 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Pacs2Q3V3Q7 2410003L11Rik-202ENSMUST00000145262 642 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pacs2Q3V3Q7 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pacs2Q3V3Q7 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pacs2Q3V3Q7 Gm29013-201ENSMUST00000187431 237 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Pacs2Q3V3Q7 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pacs2Q3V3Q7 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pacs2Q3V3Q7 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pacs2Q3V3Q7 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pacs2Q3V3Q7 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pacs2Q3V3Q7 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Pacs2Q3V3Q7 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pacs2Q3V3Q7 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pacs2Q3V3Q7 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pacs2Q3V3Q7 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pacs2Q3V3Q7 Gm18719-201ENSMUST00000196696 1413 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Pacs2Q3V3Q7 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pacs2Q3V3Q7 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Pacs2Q3V3Q7 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pacs2Q3V3Q7 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pacs2Q3V3Q7 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pacs2Q3V3Q7 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pacs2Q3V3Q7 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pacs2Q3V3Q7 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pacs2Q3V3Q7 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pacs2Q3V3Q7 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pacs2Q3V3Q7 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pacs2Q3V3Q7 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pacs2Q3V3Q7 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pacs2Q3V3Q7 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pacs2Q3V3Q7 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pacs2Q3V3Q7 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pacs2Q3V3Q7 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pacs2Q3V3Q7 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pacs2Q3V3Q7 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pacs2Q3V3Q7 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pacs2Q3V3Q7 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Pacs2Q3V3Q7 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pacs2Q3V3Q7 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Pacs2Q3V3Q7 Gm28923-201ENSMUST00000187755 322 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Pacs2Q3V3Q7 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Pacs2Q3V3Q7 1700041M19Rik-202ENSMUST00000190908 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pacs2Q3V3Q7 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms