Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Lrrc43Q3V0L5 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Lrrc43Q3V0L5 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lrrc43Q3V0L5 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lrrc43Q3V0L5 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lrrc43Q3V0L5 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lrrc43Q3V0L5 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lrrc43Q3V0L5 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lrrc43Q3V0L5 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lrrc43Q3V0L5 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lrrc43Q3V0L5 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lrrc43Q3V0L5 Cd3e-201ENSMUST00000102832 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lrrc43Q3V0L5 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lrrc43Q3V0L5 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lrrc43Q3V0L5 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lrrc43Q3V0L5 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lrrc43Q3V0L5 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lrrc43Q3V0L5 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lrrc43Q3V0L5 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lrrc43Q3V0L5 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lrrc43Q3V0L5 Gm12600-201ENSMUST00000146704 708 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lrrc43Q3V0L5 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Lrrc43Q3V0L5 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lrrc43Q3V0L5 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lrrc43Q3V0L5 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lrrc43Q3V0L5 AC160061.1-201ENSMUST00000217766 533 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lrrc43Q3V0L5 Acbd7-202ENSMUST00000228935 534 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lrrc43Q3V0L5 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lrrc43Q3V0L5 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lrrc43Q3V0L5 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lrrc43Q3V0L5 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lrrc43Q3V0L5 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lrrc43Q3V0L5 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lrrc43Q3V0L5 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lrrc43Q3V0L5 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lrrc43Q3V0L5 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lrrc43Q3V0L5 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lrrc43Q3V0L5 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lrrc43Q3V0L5 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lrrc43Q3V0L5 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lrrc43Q3V0L5 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lrrc43Q3V0L5 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lrrc43Q3V0L5 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lrrc43Q3V0L5 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lrrc43Q3V0L5 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Lrrc43Q3V0L5 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lrrc43Q3V0L5 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lrrc43Q3V0L5 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lrrc43Q3V0L5 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lrrc43Q3V0L5 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lrrc43Q3V0L5 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lrrc43Q3V0L5 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lrrc43Q3V0L5 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lrrc43Q3V0L5 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lrrc43Q3V0L5 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Lrrc43Q3V0L5 Gm13033-201ENSMUST00000117591 1057 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Lrrc43Q3V0L5 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Lrrc43Q3V0L5 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lrrc43Q3V0L5 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lrrc43Q3V0L5 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lrrc43Q3V0L5 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lrrc43Q3V0L5 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Lrrc43Q3V0L5 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lrrc43Q3V0L5 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lrrc43Q3V0L5 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Lrrc43Q3V0L5 AC154683.1-201ENSMUST00000228409 1284 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Lrrc43Q3V0L5 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lrrc43Q3V0L5 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lrrc43Q3V0L5 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lrrc43Q3V0L5 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lrrc43Q3V0L5 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lrrc43Q3V0L5 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lrrc43Q3V0L5 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lrrc43Q3V0L5 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lrrc43Q3V0L5 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lrrc43Q3V0L5 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lrrc43Q3V0L5 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Lrrc43Q3V0L5 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lrrc43Q3V0L5 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lrrc43Q3V0L5 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lrrc43Q3V0L5 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lrrc43Q3V0L5 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lrrc43Q3V0L5 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lrrc43Q3V0L5 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lrrc43Q3V0L5 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lrrc43Q3V0L5 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lrrc43Q3V0L5 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Lrrc43Q3V0L5 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Lrrc43Q3V0L5 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Lrrc43Q3V0L5 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lrrc43Q3V0L5 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Lrrc43Q3V0L5 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lrrc43Q3V0L5 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Lrrc43Q3V0L5 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Lrrc43Q3V0L5 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lrrc43Q3V0L5 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Lrrc43Q3V0L5 4930550C14Rik-204ENSMUST00000217318 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lrrc43Q3V0L5 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Lrrc43Q3V0L5 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lrrc43Q3V0L5 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms