Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZ39

Lrrfip1, Leucine-rich repeat flightless-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrfip1Q3UZ39 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrfip1Q3UZ39 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrfip1Q3UZ39 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrfip1Q3UZ39 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrfip1Q3UZ39 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrfip1Q3UZ39 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrfip1Q3UZ39 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrfip1Q3UZ39 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrfip1Q3UZ39 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrfip1Q3UZ39 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrfip1Q3UZ39 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrfip1Q3UZ39 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrfip1Q3UZ39 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrfip1Q3UZ39 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrfip1Q3UZ39 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrfip1Q3UZ39 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrfip1Q3UZ39 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrfip1Q3UZ39 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrfip1Q3UZ39 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrfip1Q3UZ39 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrfip1Q3UZ39 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrfip1Q3UZ39 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrfip1Q3UZ39 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrfip1Q3UZ39 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrfip1Q3UZ39 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrfip1Q3UZ39 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrfip1Q3UZ39 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrfip1Q3UZ39 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrfip1Q3UZ39 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrfip1Q3UZ39 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrfip1Q3UZ39 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrfip1Q3UZ39 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrfip1Q3UZ39 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrfip1Q3UZ39 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrfip1Q3UZ39 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrfip1Q3UZ39 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrfip1Q3UZ39 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrfip1Q3UZ39 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrfip1Q3UZ39 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrfip1Q3UZ39 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrfip1Q3UZ39 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrfip1Q3UZ39 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrfip1Q3UZ39 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrfip1Q3UZ39 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrfip1Q3UZ39 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrfip1Q3UZ39 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrfip1Q3UZ39 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrfip1Q3UZ39 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrfip1Q3UZ39 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrfip1Q3UZ39 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrfip1Q3UZ39 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrfip1Q3UZ39 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrfip1Q3UZ39 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrfip1Q3UZ39 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrfip1Q3UZ39 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrfip1Q3UZ39 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrfip1Q3UZ39 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrfip1Q3UZ39 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrfip1Q3UZ39 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrfip1Q3UZ39 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrfip1Q3UZ39 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrfip1Q3UZ39 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrfip1Q3UZ39 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrfip1Q3UZ39 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrfip1Q3UZ39 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrfip1Q3UZ39 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrfip1Q3UZ39 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrfip1Q3UZ39 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrfip1Q3UZ39 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrfip1Q3UZ39 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrfip1Q3UZ39 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrfip1Q3UZ39 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrfip1Q3UZ39 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrfip1Q3UZ39 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrfip1Q3UZ39 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrfip1Q3UZ39 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrfip1Q3UZ39 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrfip1Q3UZ39 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrfip1Q3UZ39 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrfip1Q3UZ39 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrfip1Q3UZ39 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrfip1Q3UZ39 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrfip1Q3UZ39 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrfip1Q3UZ39 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrfip1Q3UZ39 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrfip1Q3UZ39 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrfip1Q3UZ39 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrfip1Q3UZ39 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrfip1Q3UZ39 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrfip1Q3UZ39 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrfip1Q3UZ39 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrfip1Q3UZ39 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrfip1Q3UZ39 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrfip1Q3UZ39 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrfip1Q3UZ39 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrfip1Q3UZ39 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrfip1Q3UZ39 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrfip1Q3UZ39 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrfip1Q3UZ39 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrfip1Q3UZ39 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms