Protein–RNA interactions for Protein: Q3UXZ9

Kdm5a, Lysine-specific demethylase 5A, mousemouse

Predictions only

Length 1,690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5aQ3UXZ9 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Kdm5aQ3UXZ9 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Kdm5aQ3UXZ9 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Kdm5aQ3UXZ9 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Kdm5aQ3UXZ9 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Kdm5aQ3UXZ9 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Kdm5aQ3UXZ9 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Kdm5aQ3UXZ9 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Kdm5aQ3UXZ9 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Kdm5aQ3UXZ9 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Kdm5aQ3UXZ9 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Kdm5aQ3UXZ9 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Kdm5aQ3UXZ9 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Kdm5aQ3UXZ9 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Kdm5aQ3UXZ9 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Kdm5aQ3UXZ9 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Kdm5aQ3UXZ9 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Kdm5aQ3UXZ9 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Kdm5aQ3UXZ9 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Kdm5aQ3UXZ9 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Kdm5aQ3UXZ9 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Kdm5aQ3UXZ9 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Kdm5aQ3UXZ9 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Kdm5aQ3UXZ9 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Kdm5aQ3UXZ9 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Kdm5aQ3UXZ9 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Kdm5aQ3UXZ9 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Kdm5aQ3UXZ9 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Kdm5aQ3UXZ9 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Kdm5aQ3UXZ9 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Kdm5aQ3UXZ9 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Kdm5aQ3UXZ9 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Kdm5aQ3UXZ9 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Kdm5aQ3UXZ9 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Kdm5aQ3UXZ9 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Kdm5aQ3UXZ9 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Kdm5aQ3UXZ9 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Kdm5aQ3UXZ9 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Kdm5aQ3UXZ9 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Kdm5aQ3UXZ9 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Kdm5aQ3UXZ9 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Kdm5aQ3UXZ9 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Kdm5aQ3UXZ9 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Kdm5aQ3UXZ9 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Kdm5aQ3UXZ9 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Kdm5aQ3UXZ9 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Kdm5aQ3UXZ9 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Kdm5aQ3UXZ9 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Kdm5aQ3UXZ9 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Kdm5aQ3UXZ9 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Kdm5aQ3UXZ9 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Kdm5aQ3UXZ9 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Kdm5aQ3UXZ9 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Kdm5aQ3UXZ9 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Kdm5aQ3UXZ9 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Kdm5aQ3UXZ9 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Kdm5aQ3UXZ9 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Kdm5aQ3UXZ9 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Kdm5aQ3UXZ9 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Kdm5aQ3UXZ9 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Kdm5aQ3UXZ9 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Kdm5aQ3UXZ9 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Kdm5aQ3UXZ9 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Kdm5aQ3UXZ9 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Kdm5aQ3UXZ9 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Kdm5aQ3UXZ9 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Kdm5aQ3UXZ9 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Kdm5aQ3UXZ9 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Kdm5aQ3UXZ9 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Kdm5aQ3UXZ9 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Kdm5aQ3UXZ9 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Kdm5aQ3UXZ9 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Kdm5aQ3UXZ9 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Kdm5aQ3UXZ9 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Kdm5aQ3UXZ9 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Kdm5aQ3UXZ9 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Kdm5aQ3UXZ9 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Kdm5aQ3UXZ9 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Kdm5aQ3UXZ9 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Kdm5aQ3UXZ9 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Kdm5aQ3UXZ9 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Kdm5aQ3UXZ9 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Kdm5aQ3UXZ9 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Kdm5aQ3UXZ9 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Kdm5aQ3UXZ9 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Kdm5aQ3UXZ9 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Kdm5aQ3UXZ9 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Kdm5aQ3UXZ9 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Kdm5aQ3UXZ9 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Kdm5aQ3UXZ9 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Kdm5aQ3UXZ9 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Kdm5aQ3UXZ9 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Kdm5aQ3UXZ9 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Kdm5aQ3UXZ9 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Kdm5aQ3UXZ9 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Kdm5aQ3UXZ9 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Kdm5aQ3UXZ9 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Kdm5aQ3UXZ9 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Kdm5aQ3UXZ9 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Kdm5aQ3UXZ9 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.2 ms