Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

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Length 591 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf48Q3US17 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Znf48Q3US17 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Znf48Q3US17 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Znf48Q3US17 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Znf48Q3US17 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Znf48Q3US17 A330048O09Rik-201ENSMUST00000180777 672 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Znf48Q3US17 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Znf48Q3US17 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Znf48Q3US17 Gm37629-201ENSMUST00000193635 1050 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Znf48Q3US17 6720482G16Rik-201ENSMUST00000199552 1192 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Znf48Q3US17 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Znf48Q3US17 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Znf48Q3US17 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Znf48Q3US17 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Znf48Q3US17 AC125539.1-202ENSMUST00000226449 670 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Znf48Q3US17 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Znf48Q3US17 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Znf48Q3US17 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Znf48Q3US17 Gm42535-201ENSMUST00000197312 1399 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Znf48Q3US17 EU599041-202ENSMUST00000205291 1386 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Znf48Q3US17 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Znf48Q3US17 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Znf48Q3US17 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Znf48Q3US17 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Znf48Q3US17 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Znf48Q3US17 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Znf48Q3US17 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Znf48Q3US17 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Znf48Q3US17 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Znf48Q3US17 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Znf48Q3US17 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Znf48Q3US17 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Znf48Q3US17 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Znf48Q3US17 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Znf48Q3US17 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Znf48Q3US17 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Znf48Q3US17 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Znf48Q3US17 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Znf48Q3US17 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Znf48Q3US17 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Znf48Q3US17 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Znf48Q3US17 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Znf48Q3US17 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Znf48Q3US17 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Znf48Q3US17 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Znf48Q3US17 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Znf48Q3US17 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Znf48Q3US17 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Znf48Q3US17 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Znf48Q3US17 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Znf48Q3US17 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Znf48Q3US17 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Znf48Q3US17 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Znf48Q3US17 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Znf48Q3US17 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Znf48Q3US17 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Znf48Q3US17 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Znf48Q3US17 Gm28877-201ENSMUST00000191349 604 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Znf48Q3US17 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Znf48Q3US17 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Znf48Q3US17 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Znf48Q3US17 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Znf48Q3US17 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Znf48Q3US17 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
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Znf48Q3US17 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
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Znf48Q3US17 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Znf48Q3US17 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Znf48Q3US17 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
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Znf48Q3US17 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Znf48Q3US17 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Znf48Q3US17 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Znf48Q3US17 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Znf48Q3US17 Gm29644-201ENSMUST00000189003 1341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Znf48Q3US17 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Znf48Q3US17 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Znf48Q3US17 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Znf48Q3US17 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Znf48Q3US17 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Znf48Q3US17 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Znf48Q3US17 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Znf48Q3US17 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Znf48Q3US17 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Znf48Q3US17 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Znf48Q3US17 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Znf48Q3US17 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Znf48Q3US17 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Znf48Q3US17 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Znf48Q3US17 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Znf48Q3US17 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Znf48Q3US17 Gm14399-202ENSMUST00000108929 813 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Znf48Q3US17 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Znf48Q3US17 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Znf48Q3US17 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Znf48Q3US17 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Znf48Q3US17 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Znf48Q3US17 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
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