Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPL0

Sec31a, Protein transport protein Sec31A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec31aQ3UPL0 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sec31aQ3UPL0 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sec31aQ3UPL0 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sec31aQ3UPL0 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sec31aQ3UPL0 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sec31aQ3UPL0 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sec31aQ3UPL0 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sec31aQ3UPL0 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sec31aQ3UPL0 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sec31aQ3UPL0 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sec31aQ3UPL0 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sec31aQ3UPL0 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sec31aQ3UPL0 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sec31aQ3UPL0 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sec31aQ3UPL0 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sec31aQ3UPL0 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sec31aQ3UPL0 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sec31aQ3UPL0 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sec31aQ3UPL0 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Sec31aQ3UPL0 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Sec31aQ3UPL0 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Sec31aQ3UPL0 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Sec31aQ3UPL0 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Sec31aQ3UPL0 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sec31aQ3UPL0 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sec31aQ3UPL0 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Sec31aQ3UPL0 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sec31aQ3UPL0 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sec31aQ3UPL0 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sec31aQ3UPL0 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sec31aQ3UPL0 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Sec31aQ3UPL0 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Sec31aQ3UPL0 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Sec31aQ3UPL0 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sec31aQ3UPL0 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sec31aQ3UPL0 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Sec31aQ3UPL0 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sec31aQ3UPL0 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sec31aQ3UPL0 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sec31aQ3UPL0 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sec31aQ3UPL0 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sec31aQ3UPL0 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sec31aQ3UPL0 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sec31aQ3UPL0 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sec31aQ3UPL0 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sec31aQ3UPL0 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sec31aQ3UPL0 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sec31aQ3UPL0 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sec31aQ3UPL0 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sec31aQ3UPL0 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sec31aQ3UPL0 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sec31aQ3UPL0 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sec31aQ3UPL0 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sec31aQ3UPL0 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sec31aQ3UPL0 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sec31aQ3UPL0 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sec31aQ3UPL0 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Sec31aQ3UPL0 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sec31aQ3UPL0 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sec31aQ3UPL0 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sec31aQ3UPL0 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Sec31aQ3UPL0 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Sec31aQ3UPL0 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sec31aQ3UPL0 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sec31aQ3UPL0 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sec31aQ3UPL0 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sec31aQ3UPL0 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sec31aQ3UPL0 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sec31aQ3UPL0 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Sec31aQ3UPL0 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Sec31aQ3UPL0 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sec31aQ3UPL0 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sec31aQ3UPL0 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sec31aQ3UPL0 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sec31aQ3UPL0 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sec31aQ3UPL0 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sec31aQ3UPL0 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sec31aQ3UPL0 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Sec31aQ3UPL0 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sec31aQ3UPL0 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sec31aQ3UPL0 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sec31aQ3UPL0 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sec31aQ3UPL0 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sec31aQ3UPL0 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sec31aQ3UPL0 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sec31aQ3UPL0 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sec31aQ3UPL0 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sec31aQ3UPL0 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sec31aQ3UPL0 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sec31aQ3UPL0 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sec31aQ3UPL0 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sec31aQ3UPL0 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sec31aQ3UPL0 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sec31aQ3UPL0 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sec31aQ3UPL0 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sec31aQ3UPL0 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sec31aQ3UPL0 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sec31aQ3UPL0 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Sec31aQ3UPL0 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sec31aQ3UPL0 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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