Protein–RNA interactions for Protein: Q3UI66

Ccdc34, Coiled-coil domain-containing protein 34, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc34Q3UI66 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc34Q3UI66 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc34Q3UI66 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc34Q3UI66 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc34Q3UI66 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc34Q3UI66 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc34Q3UI66 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc34Q3UI66 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc34Q3UI66 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc34Q3UI66 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc34Q3UI66 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc34Q3UI66 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc34Q3UI66 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc34Q3UI66 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc34Q3UI66 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc34Q3UI66 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc34Q3UI66 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc34Q3UI66 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc34Q3UI66 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc34Q3UI66 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc34Q3UI66 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc34Q3UI66 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc34Q3UI66 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc34Q3UI66 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc34Q3UI66 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc34Q3UI66 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc34Q3UI66 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc34Q3UI66 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc34Q3UI66 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc34Q3UI66 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc34Q3UI66 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc34Q3UI66 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc34Q3UI66 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc34Q3UI66 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc34Q3UI66 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc34Q3UI66 Olfr293-201ENSMUST00000081474 1011 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc34Q3UI66 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc34Q3UI66 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc34Q3UI66 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc34Q3UI66 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc34Q3UI66 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc34Q3UI66 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc34Q3UI66 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc34Q3UI66 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc34Q3UI66 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc34Q3UI66 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc34Q3UI66 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc34Q3UI66 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc34Q3UI66 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc34Q3UI66 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc34Q3UI66 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc34Q3UI66 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc34Q3UI66 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc34Q3UI66 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc34Q3UI66 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc34Q3UI66 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc34Q3UI66 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc34Q3UI66 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc34Q3UI66 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc34Q3UI66 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc34Q3UI66 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc34Q3UI66 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc34Q3UI66 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc34Q3UI66 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc34Q3UI66 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc34Q3UI66 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc34Q3UI66 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc34Q3UI66 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc34Q3UI66 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc34Q3UI66 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc34Q3UI66 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc34Q3UI66 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc34Q3UI66 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc34Q3UI66 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc34Q3UI66 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc34Q3UI66 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc34Q3UI66 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc34Q3UI66 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc34Q3UI66 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc34Q3UI66 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc34Q3UI66 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc34Q3UI66 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc34Q3UI66 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc34Q3UI66 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc34Q3UI66 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc34Q3UI66 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc34Q3UI66 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc34Q3UI66 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc34Q3UI66 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc34Q3UI66 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc34Q3UI66 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc34Q3UI66 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc34Q3UI66 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc34Q3UI66 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc34Q3UI66 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc34Q3UI66 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc34Q3UI66 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc34Q3UI66 Defa-ps4-201ENSMUST00000118021 183 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc34Q3UI66 2410003L11Rik-202ENSMUST00000145262 642 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc34Q3UI66 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms