Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHH1

Zswim8, Zinc finger SWIM domain-containing protein 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,832 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zswim8Q3UHH1 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zswim8Q3UHH1 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zswim8Q3UHH1 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zswim8Q3UHH1 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zswim8Q3UHH1 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zswim8Q3UHH1 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zswim8Q3UHH1 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zswim8Q3UHH1 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zswim8Q3UHH1 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Zswim8Q3UHH1 4930538E20Rik-202ENSMUST00000146717 497 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zswim8Q3UHH1 Gm13703-201ENSMUST00000150705 449 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zswim8Q3UHH1 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zswim8Q3UHH1 Bcap31-201ENSMUST00000002091 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zswim8Q3UHH1 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zswim8Q3UHH1 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zswim8Q3UHH1 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Zswim8Q3UHH1 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Zswim8Q3UHH1 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zswim8Q3UHH1 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zswim8Q3UHH1 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zswim8Q3UHH1 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zswim8Q3UHH1 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zswim8Q3UHH1 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zswim8Q3UHH1 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zswim8Q3UHH1 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zswim8Q3UHH1 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zswim8Q3UHH1 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zswim8Q3UHH1 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zswim8Q3UHH1 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zswim8Q3UHH1 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zswim8Q3UHH1 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zswim8Q3UHH1 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zswim8Q3UHH1 Olfr22-ps1-201ENSMUST00000115991 1237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zswim8Q3UHH1 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Zswim8Q3UHH1 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Zswim8Q3UHH1 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zswim8Q3UHH1 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zswim8Q3UHH1 Tlx1-202ENSMUST00000174617 806 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zswim8Q3UHH1 Gm3671-201ENSMUST00000182463 1007 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Zswim8Q3UHH1 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Zswim8Q3UHH1 D3Ertd751e-215ENSMUST00000195882 680 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zswim8Q3UHH1 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zswim8Q3UHH1 Gm45460-201ENSMUST00000211385 1038 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zswim8Q3UHH1 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zswim8Q3UHH1 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zswim8Q3UHH1 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zswim8Q3UHH1 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zswim8Q3UHH1 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zswim8Q3UHH1 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zswim8Q3UHH1 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zswim8Q3UHH1 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Zswim8Q3UHH1 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zswim8Q3UHH1 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Zswim8Q3UHH1 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zswim8Q3UHH1 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zswim8Q3UHH1 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zswim8Q3UHH1 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Zswim8Q3UHH1 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zswim8Q3UHH1 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zswim8Q3UHH1 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zswim8Q3UHH1 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zswim8Q3UHH1 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zswim8Q3UHH1 Olfr567-ps1-201ENSMUST00000210349 857 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Zswim8Q3UHH1 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Zswim8Q3UHH1 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zswim8Q3UHH1 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zswim8Q3UHH1 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zswim8Q3UHH1 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zswim8Q3UHH1 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Zswim8Q3UHH1 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zswim8Q3UHH1 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zswim8Q3UHH1 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zswim8Q3UHH1 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zswim8Q3UHH1 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zswim8Q3UHH1 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zswim8Q3UHH1 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zswim8Q3UHH1 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zswim8Q3UHH1 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zswim8Q3UHH1 Isl1-202ENSMUST00000176044 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zswim8Q3UHH1 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zswim8Q3UHH1 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zswim8Q3UHH1 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zswim8Q3UHH1 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zswim8Q3UHH1 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zswim8Q3UHH1 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zswim8Q3UHH1 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zswim8Q3UHH1 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zswim8Q3UHH1 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zswim8Q3UHH1 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Zswim8Q3UHH1 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Zswim8Q3UHH1 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Zswim8Q3UHH1 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Zswim8Q3UHH1 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Zswim8Q3UHH1 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Zswim8Q3UHH1 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Zswim8Q3UHH1 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zswim8Q3UHH1 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zswim8Q3UHH1 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zswim8Q3UHH1 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zswim8Q3UHH1 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms