Protein–RNA interactions for Protein: Q3U9G9

Lbr, Lamin-B receptor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 626 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LbrQ3U9G9 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
LbrQ3U9G9 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
LbrQ3U9G9 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
LbrQ3U9G9 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
LbrQ3U9G9 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
LbrQ3U9G9 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
LbrQ3U9G9 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
LbrQ3U9G9 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
LbrQ3U9G9 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
LbrQ3U9G9 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
LbrQ3U9G9 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
LbrQ3U9G9 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
LbrQ3U9G9 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
LbrQ3U9G9 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
LbrQ3U9G9 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
LbrQ3U9G9 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
LbrQ3U9G9 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
LbrQ3U9G9 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
LbrQ3U9G9 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
LbrQ3U9G9 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
LbrQ3U9G9 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
LbrQ3U9G9 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
LbrQ3U9G9 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
LbrQ3U9G9 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
LbrQ3U9G9 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
LbrQ3U9G9 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
LbrQ3U9G9 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
LbrQ3U9G9 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
LbrQ3U9G9 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
LbrQ3U9G9 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
LbrQ3U9G9 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
LbrQ3U9G9 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
LbrQ3U9G9 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
LbrQ3U9G9 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
LbrQ3U9G9 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
LbrQ3U9G9 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
LbrQ3U9G9 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
LbrQ3U9G9 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
LbrQ3U9G9 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
LbrQ3U9G9 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
LbrQ3U9G9 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
LbrQ3U9G9 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
LbrQ3U9G9 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
LbrQ3U9G9 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
LbrQ3U9G9 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
LbrQ3U9G9 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
LbrQ3U9G9 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
LbrQ3U9G9 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
LbrQ3U9G9 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
LbrQ3U9G9 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
LbrQ3U9G9 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
LbrQ3U9G9 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
LbrQ3U9G9 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
LbrQ3U9G9 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
LbrQ3U9G9 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
LbrQ3U9G9 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
LbrQ3U9G9 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
LbrQ3U9G9 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
LbrQ3U9G9 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
LbrQ3U9G9 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
LbrQ3U9G9 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
LbrQ3U9G9 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
LbrQ3U9G9 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
LbrQ3U9G9 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
LbrQ3U9G9 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
LbrQ3U9G9 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
LbrQ3U9G9 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
LbrQ3U9G9 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
LbrQ3U9G9 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
LbrQ3U9G9 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
LbrQ3U9G9 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
LbrQ3U9G9 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
LbrQ3U9G9 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
LbrQ3U9G9 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
LbrQ3U9G9 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.12
LbrQ3U9G9 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
LbrQ3U9G9 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
LbrQ3U9G9 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
LbrQ3U9G9 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
LbrQ3U9G9 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
LbrQ3U9G9 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
LbrQ3U9G9 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
LbrQ3U9G9 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
LbrQ3U9G9 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
LbrQ3U9G9 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
LbrQ3U9G9 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
LbrQ3U9G9 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
LbrQ3U9G9 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
LbrQ3U9G9 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
LbrQ3U9G9 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
LbrQ3U9G9 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
LbrQ3U9G9 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
LbrQ3U9G9 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
LbrQ3U9G9 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
LbrQ3U9G9 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
LbrQ3U9G9 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
LbrQ3U9G9 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
LbrQ3U9G9 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
LbrQ3U9G9 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
LbrQ3U9G9 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms