Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q3U6N9 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q3U6N9 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q3U6N9 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q3U6N9 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q3U6N9 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q3U6N9 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q3U6N9 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q3U6N9 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q3U6N9 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q3U6N9 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q3U6N9 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q3U6N9 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q3U6N9 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q3U6N9 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q3U6N9 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q3U6N9 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q3U6N9 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Q3U6N9 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Q3U6N9 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q3U6N9 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q3U6N9 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q3U6N9 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Q3U6N9 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q3U6N9 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Q3U6N9 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q3U6N9 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q3U6N9 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q3U6N9 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q3U6N9 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q3U6N9 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Q3U6N9 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Q3U6N9 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q3U6N9 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q3U6N9 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q3U6N9 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q3U6N9 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q3U6N9 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q3U6N9 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q3U6N9 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q3U6N9 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q3U6N9 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q3U6N9 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q3U6N9 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q3U6N9 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q3U6N9 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q3U6N9 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q3U6N9 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q3U6N9 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q3U6N9 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q3U6N9 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q3U6N9 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q3U6N9 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q3U6N9 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q3U6N9 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q3U6N9 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q3U6N9 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q3U6N9 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q3U6N9 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q3U6N9 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q3U6N9 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q3U6N9 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Q3U6N9 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q3U6N9 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q3U6N9 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Q3U6N9 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Q3U6N9 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q3U6N9 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q3U6N9 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q3U6N9 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q3U6N9 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Q3U6N9 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q3U6N9 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q3U6N9 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q3U6N9 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q3U6N9 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q3U6N9 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q3U6N9 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q3U6N9 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q3U6N9 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Q3U6N9 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q3U6N9 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q3U6N9 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q3U6N9 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Q3U6N9 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q3U6N9 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q3U6N9 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Q3U6N9 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q3U6N9 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q3U6N9 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q3U6N9 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q3U6N9 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q3U6N9 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q3U6N9 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q3U6N9 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q3U6N9 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q3U6N9 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
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