Protein–RNA interactions for Protein: Q3U595

UPF0545 protein C22orf39 homolog, mousemouse

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Length 105 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U595 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Q3U595 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Q3U595 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Q3U595 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Q3U595 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q3U595 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q3U595 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q3U595 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q3U595 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q3U595 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q3U595 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q3U595 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q3U595 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q3U595 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q3U595 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q3U595 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q3U595 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q3U595 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q3U595 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q3U595 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q3U595 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q3U595 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Q3U595 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q3U595 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q3U595 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q3U595 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Q3U595 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Q3U595 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q3U595 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q3U595 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q3U595 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q3U595 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q3U595 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q3U595 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q3U595 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q3U595 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q3U595 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q3U595 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q3U595 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q3U595 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q3U595 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q3U595 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q3U595 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q3U595 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q3U595 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q3U595 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q3U595 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Q3U595 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q3U595 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q3U595 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q3U595 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q3U595 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q3U595 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q3U595 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q3U595 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q3U595 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q3U595 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q3U595 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q3U595 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q3U595 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q3U595 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q3U595 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q3U595 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q3U595 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q3U595 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q3U595 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q3U595 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q3U595 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q3U595 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q3U595 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q3U595 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q3U595 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Q3U595 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q3U595 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q3U595 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Q3U595 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q3U595 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q3U595 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q3U595 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q3U595 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q3U595 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q3U595 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q3U595 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q3U595 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q3U595 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q3U595 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q3U595 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q3U595 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q3U595 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q3U595 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q3U595 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q3U595 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q3U595 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q3U595 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q3U595 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q3U595 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q3U595 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q3U595 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q3U595 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q3U595 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
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