Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2S4

Otud5, OTU domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud5Q3U2S4 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Otud5Q3U2S4 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Otud5Q3U2S4 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Otud5Q3U2S4 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Otud5Q3U2S4 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Otud5Q3U2S4 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Otud5Q3U2S4 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Otud5Q3U2S4 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Otud5Q3U2S4 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Otud5Q3U2S4 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Otud5Q3U2S4 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Otud5Q3U2S4 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Otud5Q3U2S4 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Otud5Q3U2S4 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Otud5Q3U2S4 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Otud5Q3U2S4 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Otud5Q3U2S4 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Otud5Q3U2S4 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Otud5Q3U2S4 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Otud5Q3U2S4 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Otud5Q3U2S4 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Otud5Q3U2S4 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Otud5Q3U2S4 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Otud5Q3U2S4 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Otud5Q3U2S4 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Otud5Q3U2S4 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Otud5Q3U2S4 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Otud5Q3U2S4 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Otud5Q3U2S4 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Otud5Q3U2S4 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Otud5Q3U2S4 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Otud5Q3U2S4 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Otud5Q3U2S4 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Otud5Q3U2S4 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Otud5Q3U2S4 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Otud5Q3U2S4 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Otud5Q3U2S4 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Otud5Q3U2S4 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Otud5Q3U2S4 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Otud5Q3U2S4 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Otud5Q3U2S4 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Otud5Q3U2S4 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Otud5Q3U2S4 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Otud5Q3U2S4 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Otud5Q3U2S4 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Otud5Q3U2S4 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Otud5Q3U2S4 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Otud5Q3U2S4 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Otud5Q3U2S4 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Otud5Q3U2S4 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Otud5Q3U2S4 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Otud5Q3U2S4 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Otud5Q3U2S4 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Otud5Q3U2S4 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Otud5Q3U2S4 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Otud5Q3U2S4 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Otud5Q3U2S4 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Otud5Q3U2S4 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Otud5Q3U2S4 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Otud5Q3U2S4 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Otud5Q3U2S4 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Otud5Q3U2S4 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Otud5Q3U2S4 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Otud5Q3U2S4 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Otud5Q3U2S4 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Otud5Q3U2S4 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Otud5Q3U2S4 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Otud5Q3U2S4 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Otud5Q3U2S4 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Otud5Q3U2S4 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Otud5Q3U2S4 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Otud5Q3U2S4 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Otud5Q3U2S4 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Otud5Q3U2S4 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Otud5Q3U2S4 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Otud5Q3U2S4 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Otud5Q3U2S4 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Otud5Q3U2S4 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Otud5Q3U2S4 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Otud5Q3U2S4 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Otud5Q3U2S4 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Otud5Q3U2S4 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Otud5Q3U2S4 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Otud5Q3U2S4 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Otud5Q3U2S4 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Otud5Q3U2S4 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Otud5Q3U2S4 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Otud5Q3U2S4 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Otud5Q3U2S4 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Otud5Q3U2S4 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Otud5Q3U2S4 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Otud5Q3U2S4 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Otud5Q3U2S4 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Otud5Q3U2S4 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Otud5Q3U2S4 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Otud5Q3U2S4 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Otud5Q3U2S4 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Otud5Q3U2S4 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Otud5Q3U2S4 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Otud5Q3U2S4 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms