Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0J8

Tbc1d2b, TBC1 domain family member 2B, mousemouse

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Length 965 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbc1d2bQ3U0J8 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Tbc1d2bQ3U0J8 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Tbc1d2bQ3U0J8 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tbc1d2bQ3U0J8 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tbc1d2bQ3U0J8 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Tbc1d2bQ3U0J8 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
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Tbc1d2bQ3U0J8 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tbc1d2bQ3U0J8 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
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Tbc1d2bQ3U0J8 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
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Tbc1d2bQ3U0J8 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Tbc1d2bQ3U0J8 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tbc1d2bQ3U0J8 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Tbc1d2bQ3U0J8 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tbc1d2bQ3U0J8 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tbc1d2bQ3U0J8 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tbc1d2bQ3U0J8 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tbc1d2bQ3U0J8 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tbc1d2bQ3U0J8 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tbc1d2bQ3U0J8 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tbc1d2bQ3U0J8 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tbc1d2bQ3U0J8 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tbc1d2bQ3U0J8 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tbc1d2bQ3U0J8 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Tbc1d2bQ3U0J8 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tbc1d2bQ3U0J8 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tbc1d2bQ3U0J8 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Tbc1d2bQ3U0J8 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Tbc1d2bQ3U0J8 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tbc1d2bQ3U0J8 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms