Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Ccndbp1Q3TVC7 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ccndbp1Q3TVC7 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ccndbp1Q3TVC7 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Ccndbp1Q3TVC7 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ccndbp1Q3TVC7 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ccndbp1Q3TVC7 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ccndbp1Q3TVC7 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ccndbp1Q3TVC7 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ccndbp1Q3TVC7 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Ccndbp1Q3TVC7 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ccndbp1Q3TVC7 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ccndbp1Q3TVC7 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ccndbp1Q3TVC7 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ccndbp1Q3TVC7 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ccndbp1Q3TVC7 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ccndbp1Q3TVC7 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ccndbp1Q3TVC7 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ccndbp1Q3TVC7 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ccndbp1Q3TVC7 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ccndbp1Q3TVC7 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ccndbp1Q3TVC7 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ccndbp1Q3TVC7 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ccndbp1Q3TVC7 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ccndbp1Q3TVC7 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ccndbp1Q3TVC7 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
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Ccndbp1Q3TVC7 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
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Ccndbp1Q3TVC7 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ccndbp1Q3TVC7 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ccndbp1Q3TVC7 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ccndbp1Q3TVC7 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ccndbp1Q3TVC7 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Ccndbp1Q3TVC7 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Ccndbp1Q3TVC7 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Ccndbp1Q3TVC7 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Ccndbp1Q3TVC7 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Ccndbp1Q3TVC7 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Ccndbp1Q3TVC7 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Ccndbp1Q3TVC7 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Ccndbp1Q3TVC7 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Ccndbp1Q3TVC7 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Ccndbp1Q3TVC7 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Ccndbp1Q3TVC7 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Ccndbp1Q3TVC7 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
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Ccndbp1Q3TVC7 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Ccndbp1Q3TVC7 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
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Ccndbp1Q3TVC7 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
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Ccndbp1Q3TVC7 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ccndbp1Q3TVC7 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ccndbp1Q3TVC7 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
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Ccndbp1Q3TVC7 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccndbp1Q3TVC7 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccndbp1Q3TVC7 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
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