Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTP0

Shcbp1l, Testicular spindle-associated protein SHCBP1L, mousemouse

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Length 639 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shcbp1lQ3TTP0 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
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Shcbp1lQ3TTP0 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Shcbp1lQ3TTP0 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Shcbp1lQ3TTP0 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Shcbp1lQ3TTP0 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Shcbp1lQ3TTP0 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Shcbp1lQ3TTP0 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Shcbp1lQ3TTP0 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Shcbp1lQ3TTP0 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Shcbp1lQ3TTP0 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Shcbp1lQ3TTP0 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Shcbp1lQ3TTP0 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
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Shcbp1lQ3TTP0 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
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Shcbp1lQ3TTP0 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Shcbp1lQ3TTP0 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Shcbp1lQ3TTP0 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Shcbp1lQ3TTP0 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Shcbp1lQ3TTP0 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Shcbp1lQ3TTP0 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Shcbp1lQ3TTP0 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Shcbp1lQ3TTP0 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Shcbp1lQ3TTP0 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Shcbp1lQ3TTP0 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Shcbp1lQ3TTP0 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Shcbp1lQ3TTP0 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Shcbp1lQ3TTP0 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Shcbp1lQ3TTP0 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Shcbp1lQ3TTP0 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Shcbp1lQ3TTP0 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Shcbp1lQ3TTP0 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Shcbp1lQ3TTP0 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Shcbp1lQ3TTP0 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Shcbp1lQ3TTP0 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Shcbp1lQ3TTP0 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Shcbp1lQ3TTP0 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Shcbp1lQ3TTP0 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Shcbp1lQ3TTP0 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Shcbp1lQ3TTP0 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Shcbp1lQ3TTP0 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Shcbp1lQ3TTP0 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Shcbp1lQ3TTP0 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Shcbp1lQ3TTP0 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Shcbp1lQ3TTP0 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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