Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXB8

Colec11, Collectin-11, mousemouse

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Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colec11Q3SXB8 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Colec11Q3SXB8 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Colec11Q3SXB8 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Colec11Q3SXB8 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Colec11Q3SXB8 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Colec11Q3SXB8 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Colec11Q3SXB8 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Colec11Q3SXB8 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Colec11Q3SXB8 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Colec11Q3SXB8 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Colec11Q3SXB8 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Colec11Q3SXB8 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Colec11Q3SXB8 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Colec11Q3SXB8 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Colec11Q3SXB8 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Colec11Q3SXB8 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Colec11Q3SXB8 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Colec11Q3SXB8 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Colec11Q3SXB8 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Colec11Q3SXB8 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Colec11Q3SXB8 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Colec11Q3SXB8 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Colec11Q3SXB8 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Colec11Q3SXB8 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Colec11Q3SXB8 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Colec11Q3SXB8 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Colec11Q3SXB8 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Colec11Q3SXB8 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Colec11Q3SXB8 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Colec11Q3SXB8 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Colec11Q3SXB8 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Colec11Q3SXB8 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Colec11Q3SXB8 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Colec11Q3SXB8 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Colec11Q3SXB8 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Colec11Q3SXB8 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Colec11Q3SXB8 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Colec11Q3SXB8 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Colec11Q3SXB8 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Colec11Q3SXB8 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Colec11Q3SXB8 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Colec11Q3SXB8 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Colec11Q3SXB8 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Colec11Q3SXB8 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Colec11Q3SXB8 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Colec11Q3SXB8 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Colec11Q3SXB8 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Colec11Q3SXB8 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Colec11Q3SXB8 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Colec11Q3SXB8 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Colec11Q3SXB8 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Colec11Q3SXB8 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Colec11Q3SXB8 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Colec11Q3SXB8 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Colec11Q3SXB8 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Colec11Q3SXB8 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Colec11Q3SXB8 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Colec11Q3SXB8 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Colec11Q3SXB8 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Colec11Q3SXB8 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Colec11Q3SXB8 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Colec11Q3SXB8 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Colec11Q3SXB8 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Colec11Q3SXB8 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Colec11Q3SXB8 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Colec11Q3SXB8 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Colec11Q3SXB8 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Colec11Q3SXB8 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Colec11Q3SXB8 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Colec11Q3SXB8 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Colec11Q3SXB8 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Colec11Q3SXB8 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Colec11Q3SXB8 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Colec11Q3SXB8 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Colec11Q3SXB8 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Colec11Q3SXB8 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Colec11Q3SXB8 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Colec11Q3SXB8 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Colec11Q3SXB8 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Colec11Q3SXB8 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Colec11Q3SXB8 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Colec11Q3SXB8 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Colec11Q3SXB8 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Colec11Q3SXB8 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Colec11Q3SXB8 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Colec11Q3SXB8 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Colec11Q3SXB8 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Colec11Q3SXB8 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Colec11Q3SXB8 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Colec11Q3SXB8 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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