Protein–RNA interactions for Protein: Q3LR78

Zbtb38, CtBP-interacting BTB zinc finger protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb38Q3LR78 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Zbtb38Q3LR78 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Zbtb38Q3LR78 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Zbtb38Q3LR78 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Zbtb38Q3LR78 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Zbtb38Q3LR78 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Zbtb38Q3LR78 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Zbtb38Q3LR78 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Zbtb38Q3LR78 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Zbtb38Q3LR78 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Zbtb38Q3LR78 Gm10271-201ENSMUST00000092165 156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Zbtb38Q3LR78 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Zbtb38Q3LR78 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Zbtb38Q3LR78 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Zbtb38Q3LR78 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Zbtb38Q3LR78 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Zbtb38Q3LR78 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Zbtb38Q3LR78 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Zbtb38Q3LR78 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Zbtb38Q3LR78 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Zbtb38Q3LR78 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Zbtb38Q3LR78 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Zbtb38Q3LR78 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Zbtb38Q3LR78 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Zbtb38Q3LR78 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Zbtb38Q3LR78 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Zbtb38Q3LR78 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zbtb38Q3LR78 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zbtb38Q3LR78 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zbtb38Q3LR78 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zbtb38Q3LR78 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zbtb38Q3LR78 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zbtb38Q3LR78 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zbtb38Q3LR78 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zbtb38Q3LR78 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zbtb38Q3LR78 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zbtb38Q3LR78 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Zbtb38Q3LR78 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zbtb38Q3LR78 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zbtb38Q3LR78 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zbtb38Q3LR78 AC102569.1-204ENSMUST00000222816 793 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zbtb38Q3LR78 Olfr1212-201ENSMUST00000055895 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zbtb38Q3LR78 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zbtb38Q3LR78 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Zbtb38Q3LR78 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zbtb38Q3LR78 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zbtb38Q3LR78 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zbtb38Q3LR78 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zbtb38Q3LR78 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zbtb38Q3LR78 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zbtb38Q3LR78 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zbtb38Q3LR78 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zbtb38Q3LR78 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zbtb38Q3LR78 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zbtb38Q3LR78 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zbtb38Q3LR78 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zbtb38Q3LR78 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zbtb38Q3LR78 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zbtb38Q3LR78 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zbtb38Q3LR78 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zbtb38Q3LR78 Gm8369-201ENSMUST00000079855 1374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zbtb38Q3LR78 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zbtb38Q3LR78 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zbtb38Q3LR78 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zbtb38Q3LR78 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zbtb38Q3LR78 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zbtb38Q3LR78 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Zbtb38Q3LR78 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zbtb38Q3LR78 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zbtb38Q3LR78 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Zbtb38Q3LR78 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zbtb38Q3LR78 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zbtb38Q3LR78 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zbtb38Q3LR78 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zbtb38Q3LR78 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Zbtb38Q3LR78 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zbtb38Q3LR78 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zbtb38Q3LR78 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zbtb38Q3LR78 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zbtb38Q3LR78 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zbtb38Q3LR78 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zbtb38Q3LR78 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zbtb38Q3LR78 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zbtb38Q3LR78 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zbtb38Q3LR78 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zbtb38Q3LR78 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Zbtb38Q3LR78 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zbtb38Q3LR78 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Zbtb38Q3LR78 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zbtb38Q3LR78 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zbtb38Q3LR78 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zbtb38Q3LR78 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zbtb38Q3LR78 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zbtb38Q3LR78 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zbtb38Q3LR78 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Zbtb38Q3LR78 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zbtb38Q3LR78 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zbtb38Q3LR78 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zbtb38Q3LR78 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zbtb38Q3LR78 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms