Protein–RNA interactions for Protein: Q2MKA5

Chrna5, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna5Q2MKA5 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chrna5Q2MKA5 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chrna5Q2MKA5 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Chrna5Q2MKA5 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chrna5Q2MKA5 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chrna5Q2MKA5 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chrna5Q2MKA5 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Chrna5Q2MKA5 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chrna5Q2MKA5 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chrna5Q2MKA5 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chrna5Q2MKA5 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chrna5Q2MKA5 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chrna5Q2MKA5 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chrna5Q2MKA5 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chrna5Q2MKA5 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chrna5Q2MKA5 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chrna5Q2MKA5 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chrna5Q2MKA5 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chrna5Q2MKA5 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chrna5Q2MKA5 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chrna5Q2MKA5 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chrna5Q2MKA5 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chrna5Q2MKA5 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chrna5Q2MKA5 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chrna5Q2MKA5 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chrna5Q2MKA5 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chrna5Q2MKA5 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chrna5Q2MKA5 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chrna5Q2MKA5 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chrna5Q2MKA5 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chrna5Q2MKA5 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chrna5Q2MKA5 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chrna5Q2MKA5 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chrna5Q2MKA5 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chrna5Q2MKA5 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chrna5Q2MKA5 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chrna5Q2MKA5 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chrna5Q2MKA5 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chrna5Q2MKA5 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chrna5Q2MKA5 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chrna5Q2MKA5 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chrna5Q2MKA5 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chrna5Q2MKA5 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Chrna5Q2MKA5 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chrna5Q2MKA5 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chrna5Q2MKA5 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chrna5Q2MKA5 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chrna5Q2MKA5 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chrna5Q2MKA5 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chrna5Q2MKA5 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chrna5Q2MKA5 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Chrna5Q2MKA5 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chrna5Q2MKA5 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chrna5Q2MKA5 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chrna5Q2MKA5 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chrna5Q2MKA5 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chrna5Q2MKA5 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chrna5Q2MKA5 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chrna5Q2MKA5 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chrna5Q2MKA5 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chrna5Q2MKA5 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chrna5Q2MKA5 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chrna5Q2MKA5 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chrna5Q2MKA5 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chrna5Q2MKA5 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chrna5Q2MKA5 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chrna5Q2MKA5 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chrna5Q2MKA5 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chrna5Q2MKA5 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chrna5Q2MKA5 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chrna5Q2MKA5 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chrna5Q2MKA5 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chrna5Q2MKA5 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chrna5Q2MKA5 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chrna5Q2MKA5 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chrna5Q2MKA5 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chrna5Q2MKA5 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chrna5Q2MKA5 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chrna5Q2MKA5 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chrna5Q2MKA5 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chrna5Q2MKA5 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chrna5Q2MKA5 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chrna5Q2MKA5 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Chrna5Q2MKA5 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chrna5Q2MKA5 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chrna5Q2MKA5 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chrna5Q2MKA5 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Chrna5Q2MKA5 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Chrna5Q2MKA5 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chrna5Q2MKA5 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Chrna5Q2MKA5 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chrna5Q2MKA5 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chrna5Q2MKA5 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chrna5Q2MKA5 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chrna5Q2MKA5 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chrna5Q2MKA5 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chrna5Q2MKA5 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chrna5Q2MKA5 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chrna5Q2MKA5 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chrna5Q2MKA5 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.2 ms