Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ptchd1Q14B62 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ptchd1Q14B62 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ptchd1Q14B62 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ptchd1Q14B62 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ptchd1Q14B62 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ptchd1Q14B62 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ptchd1Q14B62 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ptchd1Q14B62 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ptchd1Q14B62 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ptchd1Q14B62 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ptchd1Q14B62 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ptchd1Q14B62 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ptchd1Q14B62 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ptchd1Q14B62 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ptchd1Q14B62 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ptchd1Q14B62 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ptchd1Q14B62 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ptchd1Q14B62 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ptchd1Q14B62 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ptchd1Q14B62 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ptchd1Q14B62 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
ptchd1Q14B62 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ptchd1Q14B62 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ptchd1Q14B62 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ptchd1Q14B62 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ptchd1Q14B62 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ptchd1Q14B62 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ptchd1Q14B62 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ptchd1Q14B62 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
ptchd1Q14B62 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ptchd1Q14B62 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ptchd1Q14B62 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ptchd1Q14B62 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ptchd1Q14B62 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
ptchd1Q14B62 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ptchd1Q14B62 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
ptchd1Q14B62 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ptchd1Q14B62 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ptchd1Q14B62 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ptchd1Q14B62 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ptchd1Q14B62 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ptchd1Q14B62 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ptchd1Q14B62 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ptchd1Q14B62 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ptchd1Q14B62 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ptchd1Q14B62 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ptchd1Q14B62 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ptchd1Q14B62 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ptchd1Q14B62 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ptchd1Q14B62 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ptchd1Q14B62 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ptchd1Q14B62 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ptchd1Q14B62 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ptchd1Q14B62 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ptchd1Q14B62 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ptchd1Q14B62 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ptchd1Q14B62 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ptchd1Q14B62 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ptchd1Q14B62 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ptchd1Q14B62 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ptchd1Q14B62 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ptchd1Q14B62 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ptchd1Q14B62 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ptchd1Q14B62 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ptchd1Q14B62 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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ptchd1Q14B62 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ptchd1Q14B62 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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ptchd1Q14B62 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ptchd1Q14B62 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ptchd1Q14B62 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ptchd1Q14B62 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ptchd1Q14B62 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
ptchd1Q14B62 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
ptchd1Q14B62 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
ptchd1Q14B62 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
ptchd1Q14B62 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ptchd1Q14B62 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ptchd1Q14B62 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ptchd1Q14B62 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ptchd1Q14B62 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ptchd1Q14B62 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ptchd1Q14B62 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ptchd1Q14B62 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ptchd1Q14B62 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ptchd1Q14B62 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ptchd1Q14B62 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ptchd1Q14B62 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ptchd1Q14B62 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
ptchd1Q14B62 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ptchd1Q14B62 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ptchd1Q14B62 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ptchd1Q14B62 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
ptchd1Q14B62 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ptchd1Q14B62 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ptchd1Q14B62 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ptchd1Q14B62 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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