Protein–RNA interactions for Protein: Q14AI6

Rpusd3, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Rpusd3, mousemouse

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Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd3Q14AI6 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rpusd3Q14AI6 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rpusd3Q14AI6 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rpusd3Q14AI6 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rpusd3Q14AI6 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rpusd3Q14AI6 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rpusd3Q14AI6 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rpusd3Q14AI6 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rpusd3Q14AI6 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rpusd3Q14AI6 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rpusd3Q14AI6 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rpusd3Q14AI6 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rpusd3Q14AI6 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Rpusd3Q14AI6 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rpusd3Q14AI6 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rpusd3Q14AI6 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
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Rpusd3Q14AI6 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Rpusd3Q14AI6 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Rpusd3Q14AI6 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Rpusd3Q14AI6 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rpusd3Q14AI6 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rpusd3Q14AI6 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rpusd3Q14AI6 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rpusd3Q14AI6 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rpusd3Q14AI6 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rpusd3Q14AI6 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rpusd3Q14AI6 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Rpusd3Q14AI6 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rpusd3Q14AI6 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rpusd3Q14AI6 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rpusd3Q14AI6 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rpusd3Q14AI6 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rpusd3Q14AI6 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Rpusd3Q14AI6 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rpusd3Q14AI6 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rpusd3Q14AI6 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rpusd3Q14AI6 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rpusd3Q14AI6 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rpusd3Q14AI6 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Rpusd3Q14AI6 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rpusd3Q14AI6 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rpusd3Q14AI6 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rpusd3Q14AI6 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
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Rpusd3Q14AI6 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rpusd3Q14AI6 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rpusd3Q14AI6 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rpusd3Q14AI6 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rpusd3Q14AI6 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rpusd3Q14AI6 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rpusd3Q14AI6 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
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Rpusd3Q14AI6 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
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Rpusd3Q14AI6 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
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Rpusd3Q14AI6 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rpusd3Q14AI6 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rpusd3Q14AI6 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rpusd3Q14AI6 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rpusd3Q14AI6 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Rpusd3Q14AI6 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rpusd3Q14AI6 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rpusd3Q14AI6 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rpusd3Q14AI6 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rpusd3Q14AI6 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rpusd3Q14AI6 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rpusd3Q14AI6 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rpusd3Q14AI6 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rpusd3Q14AI6 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rpusd3Q14AI6 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rpusd3Q14AI6 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rpusd3Q14AI6 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rpusd3Q14AI6 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rpusd3Q14AI6 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rpusd3Q14AI6 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rpusd3Q14AI6 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rpusd3Q14AI6 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rpusd3Q14AI6 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rpusd3Q14AI6 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rpusd3Q14AI6 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rpusd3Q14AI6 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rpusd3Q14AI6 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
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