Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Synj2bp-202ENSMUST00000114201 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpusd2Q149F1 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpusd2Q149F1 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpusd2Q149F1 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpusd2Q149F1 Gm26952-201ENSMUST00000181996 409 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpusd2Q149F1 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpusd2Q149F1 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpusd2Q149F1 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpusd2Q149F1 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpusd2Q149F1 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpusd2Q149F1 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpusd2Q149F1 Prl8a1-201ENSMUST00000006664 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpusd2Q149F1 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpusd2Q149F1 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpusd2Q149F1 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpusd2Q149F1 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpusd2Q149F1 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpusd2Q149F1 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpusd2Q149F1 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpusd2Q149F1 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpusd2Q149F1 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpusd2Q149F1 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpusd2Q149F1 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpusd2Q149F1 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpusd2Q149F1 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpusd2Q149F1 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpusd2Q149F1 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpusd2Q149F1 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpusd2Q149F1 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpusd2Q149F1 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpusd2Q149F1 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpusd2Q149F1 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpusd2Q149F1 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpusd2Q149F1 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpusd2Q149F1 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpusd2Q149F1 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpusd2Q149F1 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpusd2Q149F1 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpusd2Q149F1 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpusd2Q149F1 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpusd2Q149F1 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpusd2Q149F1 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpusd2Q149F1 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpusd2Q149F1 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpusd2Q149F1 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpusd2Q149F1 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpusd2Q149F1 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpusd2Q149F1 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpusd2Q149F1 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpusd2Q149F1 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpusd2Q149F1 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpusd2Q149F1 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpusd2Q149F1 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpusd2Q149F1 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpusd2Q149F1 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpusd2Q149F1 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpusd2Q149F1 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpusd2Q149F1 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpusd2Q149F1 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpusd2Q149F1 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpusd2Q149F1 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpusd2Q149F1 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpusd2Q149F1 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpusd2Q149F1 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpusd2Q149F1 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpusd2Q149F1 Tbata-210ENSMUST00000151886 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpusd2Q149F1 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpusd2Q149F1 Gm28707-201ENSMUST00000186134 558 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpusd2Q149F1 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpusd2Q149F1 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpusd2Q149F1 Gm19331-201ENSMUST00000193799 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpusd2Q149F1 Olfr812-202ENSMUST00000203571 1232 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpusd2Q149F1 Id2-201ENSMUST00000020974 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpusd2Q149F1 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpusd2Q149F1 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpusd2Q149F1 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpusd2Q149F1 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpusd2Q149F1 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpusd2Q149F1 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpusd2Q149F1 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpusd2Q149F1 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpusd2Q149F1 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpusd2Q149F1 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpusd2Q149F1 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpusd2Q149F1 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpusd2Q149F1 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpusd2Q149F1 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpusd2Q149F1 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpusd2Q149F1 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpusd2Q149F1 AC107452.3-201ENSMUST00000228807 1308 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpusd2Q149F1 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpusd2Q149F1 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpusd2Q149F1 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpusd2Q149F1 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpusd2Q149F1 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpusd2Q149F1 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpusd2Q149F1 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpusd2Q149F1 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpusd2Q149F1 4933405E24Rik-201ENSMUST00000131019 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpusd2Q149F1 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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