Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rundc1Q0VDN7 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rundc1Q0VDN7 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rundc1Q0VDN7 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rundc1Q0VDN7 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rundc1Q0VDN7 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rundc1Q0VDN7 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rundc1Q0VDN7 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Rundc1Q0VDN7 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Rundc1Q0VDN7 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Rundc1Q0VDN7 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rundc1Q0VDN7 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rundc1Q0VDN7 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rundc1Q0VDN7 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rundc1Q0VDN7 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rundc1Q0VDN7 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rundc1Q0VDN7 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rundc1Q0VDN7 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rundc1Q0VDN7 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rundc1Q0VDN7 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rundc1Q0VDN7 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rundc1Q0VDN7 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rundc1Q0VDN7 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rundc1Q0VDN7 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rundc1Q0VDN7 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rundc1Q0VDN7 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rundc1Q0VDN7 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rundc1Q0VDN7 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rundc1Q0VDN7 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rundc1Q0VDN7 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rundc1Q0VDN7 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rundc1Q0VDN7 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rundc1Q0VDN7 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Rundc1Q0VDN7 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rundc1Q0VDN7 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Rundc1Q0VDN7 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Rundc1Q0VDN7 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rundc1Q0VDN7 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rundc1Q0VDN7 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rundc1Q0VDN7 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rundc1Q0VDN7 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rundc1Q0VDN7 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rundc1Q0VDN7 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rundc1Q0VDN7 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rundc1Q0VDN7 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rundc1Q0VDN7 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rundc1Q0VDN7 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rundc1Q0VDN7 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Rundc1Q0VDN7 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rundc1Q0VDN7 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rundc1Q0VDN7 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rundc1Q0VDN7 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rundc1Q0VDN7 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rundc1Q0VDN7 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rundc1Q0VDN7 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rundc1Q0VDN7 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rundc1Q0VDN7 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rundc1Q0VDN7 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rundc1Q0VDN7 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rundc1Q0VDN7 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rundc1Q0VDN7 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rundc1Q0VDN7 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rundc1Q0VDN7 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Rundc1Q0VDN7 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Rundc1Q0VDN7 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rundc1Q0VDN7 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Rundc1Q0VDN7 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rundc1Q0VDN7 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Rundc1Q0VDN7 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rundc1Q0VDN7 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rundc1Q0VDN7 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rundc1Q0VDN7 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rundc1Q0VDN7 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rundc1Q0VDN7 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rundc1Q0VDN7 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rundc1Q0VDN7 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rundc1Q0VDN7 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rundc1Q0VDN7 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rundc1Q0VDN7 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rundc1Q0VDN7 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rundc1Q0VDN7 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Rundc1Q0VDN7 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rundc1Q0VDN7 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rundc1Q0VDN7 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rundc1Q0VDN7 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rundc1Q0VDN7 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rundc1Q0VDN7 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rundc1Q0VDN7 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Rundc1Q0VDN7 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rundc1Q0VDN7 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rundc1Q0VDN7 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Rundc1Q0VDN7 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rundc1Q0VDN7 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rundc1Q0VDN7 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rundc1Q0VDN7 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rundc1Q0VDN7 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rundc1Q0VDN7 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Rundc1Q0VDN7 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Rundc1Q0VDN7 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Rundc1Q0VDN7 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62 ms