Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Vps8Q0P5W1 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Vps8Q0P5W1 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Vps8Q0P5W1 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Vps8Q0P5W1 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Vps8Q0P5W1 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Vps8Q0P5W1 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Vps8Q0P5W1 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Vps8Q0P5W1 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Vps8Q0P5W1 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Vps8Q0P5W1 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Vps8Q0P5W1 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Vps8Q0P5W1 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Vps8Q0P5W1 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Vps8Q0P5W1 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Vps8Q0P5W1 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Vps8Q0P5W1 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Vps8Q0P5W1 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Vps8Q0P5W1 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Vps8Q0P5W1 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Vps8Q0P5W1 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Vps8Q0P5W1 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Vps8Q0P5W1 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Vps8Q0P5W1 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Vps8Q0P5W1 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Vps8Q0P5W1 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Vps8Q0P5W1 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Vps8Q0P5W1 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Vps8Q0P5W1 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Vps8Q0P5W1 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Vps8Q0P5W1 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Vps8Q0P5W1 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
Vps8Q0P5W1 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Vps8Q0P5W1 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
Vps8Q0P5W1 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.74
Vps8Q0P5W1 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
Vps8Q0P5W1 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Vps8Q0P5W1 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Vps8Q0P5W1 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Vps8Q0P5W1 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Vps8Q0P5W1 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Vps8Q0P5W1 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Vps8Q0P5W1 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Vps8Q0P5W1 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Vps8Q0P5W1 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Vps8Q0P5W1 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Vps8Q0P5W1 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Vps8Q0P5W1 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Vps8Q0P5W1 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Vps8Q0P5W1 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Vps8Q0P5W1 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Vps8Q0P5W1 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Vps8Q0P5W1 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Vps8Q0P5W1 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Vps8Q0P5W1 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Vps8Q0P5W1 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Vps8Q0P5W1 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Vps8Q0P5W1 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Vps8Q0P5W1 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Vps8Q0P5W1 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Vps8Q0P5W1 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Vps8Q0P5W1 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Vps8Q0P5W1 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Vps8Q0P5W1 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Vps8Q0P5W1 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Vps8Q0P5W1 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Vps8Q0P5W1 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Vps8Q0P5W1 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Vps8Q0P5W1 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Vps8Q0P5W1 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Vps8Q0P5W1 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Vps8Q0P5W1 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Vps8Q0P5W1 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Vps8Q0P5W1 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Vps8Q0P5W1 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Vps8Q0P5W1 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Vps8Q0P5W1 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Vps8Q0P5W1 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Vps8Q0P5W1 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Vps8Q0P5W1 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Vps8Q0P5W1 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Vps8Q0P5W1 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Vps8Q0P5W1 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Vps8Q0P5W1 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Vps8Q0P5W1 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Vps8Q0P5W1 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Vps8Q0P5W1 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Vps8Q0P5W1 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Vps8Q0P5W1 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Vps8Q0P5W1 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Vps8Q0P5W1 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Vps8Q0P5W1 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Vps8Q0P5W1 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Vps8Q0P5W1 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Vps8Q0P5W1 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Vps8Q0P5W1 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Vps8Q0P5W1 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Vps8Q0P5W1 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Vps8Q0P5W1 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Vps8Q0P5W1 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms