Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
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Ttc21bQ0HA38 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ttc21bQ0HA38 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Ttc21bQ0HA38 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Ttc21bQ0HA38 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Ttc21bQ0HA38 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Ttc21bQ0HA38 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ttc21bQ0HA38 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
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Ttc21bQ0HA38 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ttc21bQ0HA38 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ttc21bQ0HA38 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
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Ttc21bQ0HA38 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ttc21bQ0HA38 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ttc21bQ0HA38 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ttc21bQ0HA38 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ttc21bQ0HA38 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ttc21bQ0HA38 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ttc21bQ0HA38 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ttc21bQ0HA38 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ttc21bQ0HA38 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ttc21bQ0HA38 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
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Ttc21bQ0HA38 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
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Ttc21bQ0HA38 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Ttc21bQ0HA38 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
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Ttc21bQ0HA38 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
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Ttc21bQ0HA38 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ttc21bQ0HA38 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ttc21bQ0HA38 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
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Ttc21bQ0HA38 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ttc21bQ0HA38 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ttc21bQ0HA38 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ttc21bQ0HA38 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ttc21bQ0HA38 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ttc21bQ0HA38 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ttc21bQ0HA38 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ttc21bQ0HA38 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ttc21bQ0HA38 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ttc21bQ0HA38 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ttc21bQ0HA38 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ttc21bQ0HA38 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ttc21bQ0HA38 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ttc21bQ0HA38 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ttc21bQ0HA38 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ttc21bQ0HA38 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Ttc21bQ0HA38 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ttc21bQ0HA38 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms