Protein–RNA interactions for Protein: Q0GGX2

Znf541, Zinc finger protein 541, mousemouse

Predictions only

Length 1,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf541Q0GGX2 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Znf541Q0GGX2 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Znf541Q0GGX2 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Znf541Q0GGX2 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Znf541Q0GGX2 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Znf541Q0GGX2 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Znf541Q0GGX2 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Znf541Q0GGX2 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Znf541Q0GGX2 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Znf541Q0GGX2 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Znf541Q0GGX2 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Znf541Q0GGX2 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Znf541Q0GGX2 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Znf541Q0GGX2 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Znf541Q0GGX2 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Znf541Q0GGX2 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Znf541Q0GGX2 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Znf541Q0GGX2 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Znf541Q0GGX2 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Znf541Q0GGX2 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Znf541Q0GGX2 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Znf541Q0GGX2 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Znf541Q0GGX2 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Znf541Q0GGX2 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Znf541Q0GGX2 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Znf541Q0GGX2 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Znf541Q0GGX2 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Znf541Q0GGX2 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Znf541Q0GGX2 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Znf541Q0GGX2 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Znf541Q0GGX2 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Znf541Q0GGX2 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Znf541Q0GGX2 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Znf541Q0GGX2 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Znf541Q0GGX2 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Znf541Q0GGX2 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Znf541Q0GGX2 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Znf541Q0GGX2 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Znf541Q0GGX2 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Znf541Q0GGX2 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Znf541Q0GGX2 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Znf541Q0GGX2 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Znf541Q0GGX2 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Znf541Q0GGX2 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Znf541Q0GGX2 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Znf541Q0GGX2 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Znf541Q0GGX2 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Znf541Q0GGX2 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Znf541Q0GGX2 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Znf541Q0GGX2 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Znf541Q0GGX2 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Znf541Q0GGX2 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Znf541Q0GGX2 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Znf541Q0GGX2 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Znf541Q0GGX2 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Znf541Q0GGX2 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Znf541Q0GGX2 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Znf541Q0GGX2 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Znf541Q0GGX2 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Znf541Q0GGX2 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Znf541Q0GGX2 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Znf541Q0GGX2 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Znf541Q0GGX2 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Znf541Q0GGX2 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Znf541Q0GGX2 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Znf541Q0GGX2 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Znf541Q0GGX2 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Znf541Q0GGX2 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Znf541Q0GGX2 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Znf541Q0GGX2 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Znf541Q0GGX2 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Znf541Q0GGX2 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Znf541Q0GGX2 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Znf541Q0GGX2 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Znf541Q0GGX2 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Znf541Q0GGX2 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Znf541Q0GGX2 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Znf541Q0GGX2 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Znf541Q0GGX2 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Znf541Q0GGX2 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Znf541Q0GGX2 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Znf541Q0GGX2 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Znf541Q0GGX2 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Znf541Q0GGX2 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Znf541Q0GGX2 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Znf541Q0GGX2 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Znf541Q0GGX2 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Znf541Q0GGX2 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Znf541Q0GGX2 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Znf541Q0GGX2 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Znf541Q0GGX2 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Znf541Q0GGX2 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Znf541Q0GGX2 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Znf541Q0GGX2 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Znf541Q0GGX2 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Znf541Q0GGX2 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Znf541Q0GGX2 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Znf541Q0GGX2 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Znf541Q0GGX2 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Znf541Q0GGX2 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms