Protein–RNA interactions for Protein: Q09098

Pate4, Prostate and testis expressed protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pate4Q09098 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms