Protein–RNA interactions for Protein: Q08624

Hoxc4, Homeobox protein Hox-C4, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc4Q08624 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxc4Q08624 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxc4Q08624 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxc4Q08624 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxc4Q08624 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxc4Q08624 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxc4Q08624 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxc4Q08624 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxc4Q08624 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxc4Q08624 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxc4Q08624 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxc4Q08624 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxc4Q08624 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxc4Q08624 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxc4Q08624 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxc4Q08624 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxc4Q08624 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxc4Q08624 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxc4Q08624 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxc4Q08624 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxc4Q08624 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxc4Q08624 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxc4Q08624 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxc4Q08624 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxc4Q08624 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxc4Q08624 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxc4Q08624 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxc4Q08624 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxc4Q08624 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxc4Q08624 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxc4Q08624 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxc4Q08624 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxc4Q08624 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxc4Q08624 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxc4Q08624 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxc4Q08624 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxc4Q08624 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxc4Q08624 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxc4Q08624 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxc4Q08624 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxc4Q08624 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxc4Q08624 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxc4Q08624 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxc4Q08624 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxc4Q08624 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxc4Q08624 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxc4Q08624 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxc4Q08624 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxc4Q08624 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxc4Q08624 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxc4Q08624 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxc4Q08624 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxc4Q08624 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxc4Q08624 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxc4Q08624 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxc4Q08624 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxc4Q08624 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxc4Q08624 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxc4Q08624 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxc4Q08624 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxc4Q08624 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxc4Q08624 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxc4Q08624 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxc4Q08624 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxc4Q08624 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxc4Q08624 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxc4Q08624 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Hoxc4Q08624 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxc4Q08624 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxc4Q08624 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Hoxc4Q08624 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxc4Q08624 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxc4Q08624 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Hoxc4Q08624 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Hoxc4Q08624 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxc4Q08624 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxc4Q08624 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxc4Q08624 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxc4Q08624 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxc4Q08624 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxc4Q08624 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxc4Q08624 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxc4Q08624 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxc4Q08624 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxc4Q08624 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxc4Q08624 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxc4Q08624 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxc4Q08624 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxc4Q08624 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxc4Q08624 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxc4Q08624 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxc4Q08624 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxc4Q08624 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxc4Q08624 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxc4Q08624 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxc4Q08624 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxc4Q08624 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxc4Q08624 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxc4Q08624 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxc4Q08624 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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