Protein–RNA interactions for Protein: Q03402

Crisp3, Cysteine-rich secretory protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crisp3Q03402 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Crisp3Q03402 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Crisp3Q03402 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Crisp3Q03402 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Crisp3Q03402 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Crisp3Q03402 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Crisp3Q03402 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Crisp3Q03402 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Crisp3Q03402 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Crisp3Q03402 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Crisp3Q03402 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Crisp3Q03402 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Crisp3Q03402 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Crisp3Q03402 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Crisp3Q03402 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Crisp3Q03402 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Crisp3Q03402 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Crisp3Q03402 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Crisp3Q03402 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Crisp3Q03402 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Crisp3Q03402 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Crisp3Q03402 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Crisp3Q03402 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Crisp3Q03402 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Crisp3Q03402 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Crisp3Q03402 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Crisp3Q03402 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Crisp3Q03402 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Crisp3Q03402 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Crisp3Q03402 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Crisp3Q03402 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Crisp3Q03402 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Crisp3Q03402 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Crisp3Q03402 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Crisp3Q03402 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Crisp3Q03402 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Crisp3Q03402 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Crisp3Q03402 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Crisp3Q03402 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Crisp3Q03402 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Crisp3Q03402 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Crisp3Q03402 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Crisp3Q03402 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Crisp3Q03402 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Crisp3Q03402 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Crisp3Q03402 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Crisp3Q03402 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Crisp3Q03402 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Crisp3Q03402 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Crisp3Q03402 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Crisp3Q03402 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Crisp3Q03402 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Crisp3Q03402 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Crisp3Q03402 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Crisp3Q03402 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Crisp3Q03402 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Crisp3Q03402 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Crisp3Q03402 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Crisp3Q03402 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Crisp3Q03402 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Crisp3Q03402 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Crisp3Q03402 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Crisp3Q03402 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Crisp3Q03402 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Crisp3Q03402 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Crisp3Q03402 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Crisp3Q03402 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Crisp3Q03402 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Crisp3Q03402 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Crisp3Q03402 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Crisp3Q03402 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Crisp3Q03402 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Crisp3Q03402 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Crisp3Q03402 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Crisp3Q03402 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Crisp3Q03402 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Crisp3Q03402 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Crisp3Q03402 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Crisp3Q03402 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Crisp3Q03402 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Crisp3Q03402 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Crisp3Q03402 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Crisp3Q03402 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Crisp3Q03402 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Crisp3Q03402 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Crisp3Q03402 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Crisp3Q03402 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Crisp3Q03402 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Crisp3Q03402 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Crisp3Q03402 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Crisp3Q03402 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Crisp3Q03402 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Crisp3Q03402 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Crisp3Q03402 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Crisp3Q03402 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Crisp3Q03402 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Crisp3Q03402 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Crisp3Q03402 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Crisp3Q03402 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Crisp3Q03402 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms