Protein–RNA interactions for Protein: Q02789

Cacna1s, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, mousemouse

Predictions only

Length 1,880 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1sQ02789 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cacna1sQ02789 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cacna1sQ02789 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cacna1sQ02789 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cacna1sQ02789 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cacna1sQ02789 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cacna1sQ02789 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Cacna1sQ02789 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Cacna1sQ02789 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cacna1sQ02789 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cacna1sQ02789 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cacna1sQ02789 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cacna1sQ02789 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Cacna1sQ02789 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cacna1sQ02789 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Cacna1sQ02789 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cacna1sQ02789 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cacna1sQ02789 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cacna1sQ02789 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cacna1sQ02789 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cacna1sQ02789 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cacna1sQ02789 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cacna1sQ02789 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cacna1sQ02789 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cacna1sQ02789 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cacna1sQ02789 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cacna1sQ02789 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cacna1sQ02789 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cacna1sQ02789 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cacna1sQ02789 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cacna1sQ02789 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cacna1sQ02789 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cacna1sQ02789 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cacna1sQ02789 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cacna1sQ02789 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cacna1sQ02789 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cacna1sQ02789 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cacna1sQ02789 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cacna1sQ02789 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cacna1sQ02789 Plac9a-202ENSMUST00000183431 536 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cacna1sQ02789 Plac9b-204ENSMUST00000184675 536 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cacna1sQ02789 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cacna1sQ02789 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cacna1sQ02789 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Cacna1sQ02789 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cacna1sQ02789 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cacna1sQ02789 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cacna1sQ02789 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Cacna1sQ02789 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cacna1sQ02789 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cacna1sQ02789 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cacna1sQ02789 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cacna1sQ02789 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cacna1sQ02789 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cacna1sQ02789 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cacna1sQ02789 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Cacna1sQ02789 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Cacna1sQ02789 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Cacna1sQ02789 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cacna1sQ02789 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cacna1sQ02789 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cacna1sQ02789 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cacna1sQ02789 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cacna1sQ02789 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cacna1sQ02789 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Cacna1sQ02789 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cacna1sQ02789 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cacna1sQ02789 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cacna1sQ02789 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cacna1sQ02789 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cacna1sQ02789 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cacna1sQ02789 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cacna1sQ02789 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cacna1sQ02789 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cacna1sQ02789 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cacna1sQ02789 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Cacna1sQ02789 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Cacna1sQ02789 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cacna1sQ02789 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cacna1sQ02789 Gm38210-201ENSMUST00000191944 809 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Cacna1sQ02789 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cacna1sQ02789 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cacna1sQ02789 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cacna1sQ02789 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cacna1sQ02789 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cacna1sQ02789 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cacna1sQ02789 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cacna1sQ02789 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cacna1sQ02789 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cacna1sQ02789 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cacna1sQ02789 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Cacna1sQ02789 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cacna1sQ02789 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cacna1sQ02789 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Cacna1sQ02789 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cacna1sQ02789 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cacna1sQ02789 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Cacna1sQ02789 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Cacna1sQ02789 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cacna1sQ02789 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms