Protein–RNA interactions for Protein: Q02788

Col6a2, Collagen alpha-2(VI) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,034 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col6a2Q02788 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Col6a2Q02788 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Col6a2Q02788 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Col6a2Q02788 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Col6a2Q02788 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Col6a2Q02788 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Col6a2Q02788 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Col6a2Q02788 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Col6a2Q02788 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Col6a2Q02788 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Col6a2Q02788 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Col6a2Q02788 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Col6a2Q02788 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Col6a2Q02788 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Col6a2Q02788 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Col6a2Q02788 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Col6a2Q02788 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Col6a2Q02788 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Col6a2Q02788 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Col6a2Q02788 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Col6a2Q02788 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Col6a2Q02788 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Col6a2Q02788 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Col6a2Q02788 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Col6a2Q02788 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Col6a2Q02788 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Col6a2Q02788 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Col6a2Q02788 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Col6a2Q02788 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Col6a2Q02788 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Col6a2Q02788 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Col6a2Q02788 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Col6a2Q02788 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Col6a2Q02788 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Col6a2Q02788 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Col6a2Q02788 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Col6a2Q02788 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Col6a2Q02788 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Col6a2Q02788 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Col6a2Q02788 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Col6a2Q02788 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Col6a2Q02788 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Col6a2Q02788 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Col6a2Q02788 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Col6a2Q02788 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Col6a2Q02788 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Col6a2Q02788 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Col6a2Q02788 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Col6a2Q02788 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Col6a2Q02788 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Col6a2Q02788 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Col6a2Q02788 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Col6a2Q02788 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Col6a2Q02788 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Col6a2Q02788 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Col6a2Q02788 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Col6a2Q02788 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Col6a2Q02788 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Col6a2Q02788 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Col6a2Q02788 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Col6a2Q02788 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Col6a2Q02788 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Col6a2Q02788 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Col6a2Q02788 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Col6a2Q02788 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Col6a2Q02788 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Col6a2Q02788 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Col6a2Q02788 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Col6a2Q02788 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Col6a2Q02788 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Col6a2Q02788 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Col6a2Q02788 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Col6a2Q02788 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Col6a2Q02788 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Col6a2Q02788 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Col6a2Q02788 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Col6a2Q02788 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Col6a2Q02788 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Col6a2Q02788 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Col6a2Q02788 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Col6a2Q02788 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Col6a2Q02788 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Col6a2Q02788 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Col6a2Q02788 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Col6a2Q02788 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Col6a2Q02788 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Col6a2Q02788 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Col6a2Q02788 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Col6a2Q02788 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Col6a2Q02788 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Col6a2Q02788 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Col6a2Q02788 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Col6a2Q02788 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Col6a2Q02788 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Col6a2Q02788 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Col6a2Q02788 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Col6a2Q02788 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Col6a2Q02788 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Col6a2Q02788 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Col6a2Q02788 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms